Structure summary for 6mwr

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Details for 6mwr

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Color by element
Spin: on off

Structure information

Recognition of MHC-Like Molecule

Item	Info
PDB	6mwr
Organism	HOMO SAPIENS
Method	X-RAY DIFFRACTION
Resolution	3.3Å
Number of TCRs	1

Paired chains information

This PDB has 1 TCR(s).

D / C

TCR Details:

Item	Info
VD chain	D
VG chain	C
VD IMGT details	TRDV1/TRDJ1
VG IMGT details	TRGV9/TRGJ1
Species	human

Numbered sequence

Chain type

Chain ID

FASTA/Annotation file

IMGT numbered sequence (Framework/CDR)

VD

D

D1	D2	D3	D4	D5	D6	D7	D8
A	Q	K	V	T	Q	A	Q
D9	D10	D11	D12	D13	D14	D15	D16
S	S	V	S	M	P	V	R
D17	D18	D19	D20	D21	D22	D23	D24
K	A	V	T	L	N	C	L
D25	D26	D27	D28	D29	D30	D36	D37
Y	E	T	S	W	W	S	Y
D38	D39	D40	D41	D42	D43	D44	D45
Y	I	F	W	Y	K	Q	L
D46	D47	D48	D49	D50	D51	D52	D53
P	S	K	E	M	I	F	L
D54	D55	D56	D57	D58	D59	D63	D64
I	R	Q	G	S	D	E	Q
D65	D66	D67	D68	D74	D75	D76	D77
N	A	K	S	G	R	Y	S
D78	D79	D80	D81	D82	D83	D84	D85
V	N	F	K	K	A	A	K
D86	D87	D88	D89	D90	D91	D92	D93
S	V	A	L	T	I	S	A
D94	D95	D96	D97	D98	D99	D100	D101
L	Q	L	E	D	S	A	K
D102	D103	D104	D105	D106	D107	D108	D109
Y	F	C	A	L	G	V	R
D110	D111	D111A	D111B	D112B	D112A	D112	D113
A	F	L	R	D	W	G	I
D114	D115	D116	D117	D118	D119	D120	D121
R	V	L	I	F	G	K	G
D122	D123	D124	D125	D126	D127	D128
T	R	V	T	V	E	P

VG

C

G1	G2	G3	G4	G5	G6	G7	G8
A	G	H	L	E	Q	P	Q
G9	G10	G11	G12	G13	G14	G15	G16
I	S	S	T	K	T	L	S
G17	G18	G19	G20	G21	G22	G23	G24
K	T	A	R	L	E	C	V
G25	G26	G27	G28	G29	G30	G35	G36
V	S	G	I	T	I	S	A
G37	G38	G39	G40	G41	G42	G43	G44
T	S	V	Y	W	Y	R	E
G45	G46	G47	G48	G49	G50	G51	G52
R	P	G	E	V	I	Q	F
G53	G54	G55	G56	G57	G58	G59	G63
L	V	S	I	S	Y	D	G
G64	G65	G66	G67	G68	G69	G70	G71
T	V	R	K	E	S	G	I
G72	G73	G74	G75	G76	G77	G78	G79
P	S	G	K	F	E	V	D
G80	G81	G82	G83	G84	G85	G86	G87
R	I	P	E	T	S	T	S
G88	G89	G90	G91	G92	G93	G94	G95
T	L	T	I	H	N	V	E
G96	G97	G98	G99	G100	G101	G102	G103
K	Q	D	I	A	T	Y	Y
G104	G105	G106	G107	G108	G109	G113	G114
C	A	L	W	D	R	Y	Y
G115	G116	G117	G118	G119	G120	G121	G122
K	K	L	F	G	S	G	T
G123	G124	G125	G126	G127
T	L	V	V	T

CDR Sequences:

Loop	Sequence	Predicted canonical form	CDR Length
CDRD1	TSWWSYY	None	7
CDRD2	QGSDEQN	None	7
CDRD3	ALGVRAFLRDWGIRVLI	None	17
CDRG1	GITISATS	None	8
CDRG2	ISYDGTV	None	7
CDRG3	ALWDRYYKKL	None	10

Available downloads

Additional links and files for download: see help for more details.

Item	Link
IMGT-numbered structure	Link
Non-annotated structure from the PDB	Link
Summary file for this TCR	Link
Link in the PDB	Link