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HLA-Tcr complex
Item | Info |
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PDB | 6px6 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ31 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APFSEQEQPVLG |
Antigen Length | 12 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0201 / HLA-DQB1*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSHGASTDTQY | None | 12 |
CDRB2 | FQGTGA | None | 6 |
CDRB1 | SGHTA | None | 5 |
CDRA3 | AVHTGARLM | None | 9 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.69° |
BC1 | 74.90° |
BA | -72.63° |
AC2 | 75.51° |
AC1 | 119.99° |
dc | 15.97Å |
Docking angle | 30.44° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5swz_TS | 102.55° | 72.71° | -73.06° | 73.13° | 121.22° | 16.92Å | 4.8 |
6cqr_JI | 103.77° | 72.60° | -69.24° | 73.97° | 118.89° | 16.17Å | 4.9 |
5swz_ON | 102.92° | 72.97° | -69.95° | 76.37° | 122.18° | 16.87Å | 5.0 |
7jwi_ED | 102.83° | 72.70° | -70.72° | 73.61° | 121.98° | 16.76Å | 5.0 |
6v18_ED | 105.35° | 73.95° | -67.76° | 74.67° | 119.14° | 16.34Å | 5.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 4.5 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 6.1 |
12e8_HL | 106.48° | 69.23° | -70.96° | 74.63° | 118.60° | 16.05Å | 6.2 |
4uin_HL | 107.61° | 70.78° | -70.27° | 77.14° | 115.22° | 16.35Å | 7.2 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 7.3 |