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Ls2.8/3.15 - Dq2-P.Fluor-alpha1a complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 6u3n |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.8Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV5/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV8/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | PSEUDOMONAS FLUORESCENS |
Antigen Sequence | APMPMPELPYPGSGGSIEGR |
Antigen Length | 20 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0501 / HLA-DQB1*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLEGQGASEQF | None | 13 |
CDRB2 | YYEKEE | None | 6 |
CDRB1 | SGHKS | None | 5 |
CDRA3 | AVGAGSNYQLI | None | 11 |
CDRA2 | YFSGDTLV | None | 8 |
CDRA1 | YGATPY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.98° |
BC1 | 77.40° |
BA | -64.24° |
AC2 | 76.66° |
AC1 | 120.29° |
dc | 15.78Å |
Docking angle | 34.23° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
8cx4_FD | 104.29° | 75.46° | -65.22° | 77.54° | 119.22° | 15.63Å | 2.6 |
7n2s_FD | 105.79° | 75.67° | -63.01° | 76.83° | 119.55° | 15.81Å | 2.9 |
7n2n_FD | 105.58° | 75.18° | -63.42° | 77.58° | 119.77° | 15.95Å | 3.1 |
7sg0_ED | 102.38° | 77.02° | -65.64° | 74.45° | 120.37° | 16.11Å | 3.1 |
7n2o_FD | 106.34° | 74.73° | -64.81° | 77.13° | 120.85° | 15.94Å | 3.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.4 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 7.9 |
3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 8.4 |
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 8.6 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 8.6 |