Details for 1h5b

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Structure information

T Cell Receptor Valpha11 (av11S5) Domain

Item	Info
PDB	1h5b
Organism	MUS MUSCULUS
Method	X-RAY DIFFRACTION
Resolution	1.85Å
Number of TCRs	4

Paired chains information

This PDB has 4 TCR(s).

A / NA

TCR Details:

Item	Info
VA chain	A
VA IMGT details	TRAV4/TRAJ22
Species	mouse

Numbered sequence

Chain type

Chain ID

FASTA/Annotation file

IMGT numbered sequence (Framework/CDR)

FASTA file

A1	A2	A3	A4	A5	A6	A7	A8
G	D	Q	V	E	Q	S	P
A9	A10	A11	A12	A13	A14	A15	A16
S	A	L	S	L	H	E	G
A17	A18	A19	A20	A21	A22	A23	A24
T	D	S	A	L	R	C	N
A25	A26	A27	A28	A29	A37	A38	A39
F	T	T	T	M	R	S	V
A40	A41	A42	A43	A44	A45	A46	A47
Q	W	F	R	Q	N	S	R
A48	A49	A50	A51	A52	A53	A54	A55
G	S	L	I	S	L	F	Y
A56	A57	A58	A64	A65	A66	A67	A68
L	A	S	G	T	K	E	N
A74	A75	A76	A77	A78	A79	A80	A81
G	R	L	K	S	A	F	D
A82	A83	A84	A84A	A85	A86	A87	A88
S	E	R	A	R	Y	S	T
A89	A90	A91	A92	A93	A94	A95	A96
L	H	I	R	D	A	Q	L
A97	A98	A99	A100	A101	A102	A103	A104
E	D	S	G	T	Y	F	C
A105	A106	A107	A108	A109	A110	A112	A113
A	A	E	A	S	S	G	S
A114	A115	A116	A117	A118	A119	A120	A121
W	Q	L	I	F	G	S	G
A122	A123	A124	A125	A126	A127	A128
T	Q	L	T	V	M	P

CDR Sequences:

Loop	Sequence	Predicted canonical form	CDR Length
CDRA3	AAEASSGSWQLI	None	12
CDRA2	LASGT	None	5
CDRA1	TTMRS	None	5

B / NA

TCR Details:

Item	Info
VA chain	B
VA IMGT details	TRAV4/TRAJ22
Species	mouse

Numbered sequence

Chain type

Chain ID

FASTA/Annotation file

IMGT numbered sequence (Framework/CDR)

FASTA file

A1	A2	A3	A4	A5	A6	A7	A8
G	D	Q	V	E	Q	S	P
A9	A10	A11	A12	A13	A14	A15	A16
S	A	L	S	L	H	E	G
A17	A18	A19	A20	A21	A22	A23	A24
T	D	S	A	L	R	C	N
A25	A26	A27	A28	A29	A37	A38	A39
F	T	T	T	M	R	S	V
A40	A41	A42	A43	A44	A45	A46	A47
Q	W	F	R	Q	N	S	R
A48	A49	A50	A51	A52	A53	A54	A55
G	S	L	I	S	L	F	Y
A56	A57	A58	A64	A65	A66	A67	A68
L	A	S	G	T	K	E	N
A74	A75	A76	A77	A78	A79	A80	A81
G	R	L	K	S	A	F	D
A82	A83	A84	A84A	A85	A86	A87	A88
S	K	E	R	R	Y	S	T
A89	A90	A91	A92	A93	A94	A95	A96
L	H	I	R	D	A	Q	L
A97	A98	A99	A100	A101	A102	A103	A104
E	D	S	G	T	Y	F	C
A105	A106	A107	A108	A109	A110	A112	A113
A	A	E	A	S	S	G	A
A114	A115	A116	A117	A118	A119	A120	A121
W	Q	L	I	F	G	S	G
A122	A123	A124	A125	A126	A127	A128
T	Q	L	T	V	M	P

CDR Sequences:

Loop	Sequence	Predicted canonical form	CDR Length
CDRA3	AAEASSGAWQLI	None	12
CDRA2	LASGT	None	5
CDRA1	TTMRS	None	5

C / NA

TCR Details:

Item	Info
VA chain	C
VA IMGT details	TRAV4/TRAJ22
Species	mouse

Numbered sequence

Chain type

Chain ID

FASTA/Annotation file

IMGT numbered sequence (Framework/CDR)

FASTA file

A1	A2	A3	A4	A5	A6	A7	A8
G	D	Q	V	E	Q	S	P
A9	A10	A11	A12	A13	A14	A15	A16
S	A	L	S	L	H	E	G
A17	A18	A19	A20	A21	A22	A23	A24
T	D	S	A	L	R	C	N
A25	A26	A27	A28	A29	A37	A38	A39
F	T	T	T	M	R	S	V
A40	A41	A42	A43	A44	A45	A46	A47
Q	W	F	R	Q	N	S	R
A48	A49	A50	A51	A52	A53	A54	A55
G	S	L	I	S	L	F	Y
A56	A57	A58	A64	A65	A66	A67	A68
L	A	S	G	T	K	E	N
A74	A75	A76	A77	A78	A79	A80	A81
G	R	L	K	S	A	F	D
A82	A83	A84	A84A	A85	A86	A87	A88
S	K	E	R	R	Y	S	T
A89	A90	A91	A92	A93	A94	A95	A96
L	H	I	R	D	A	Q	L
A97	A98	A99	A100	A101	A102	A103	A104
E	D	S	G	T	Y	F	C
A105	A106	A107	A108	A109	A110	A112	A113
A	A	E	A	S	S	G	S
A114	A115	A116	A117	A118	A119	A120	A121
W	Q	L	I	F	G	S	G
A122	A123	A124	A125	A126	A127	A128
T	Q	L	T	V	M	P

CDR Sequences:

Loop	Sequence	Predicted canonical form	CDR Length
CDRA3	AAEASSGSWQLI	None	12
CDRA2	LASGT	None	5
CDRA1	TTMRS	None	5

D / NA

TCR Details:

Item	Info
VA chain	D
VA IMGT details	TRAV4/TRAJ22
Species	mouse

Numbered sequence

Chain type

Chain ID

FASTA/Annotation file

IMGT numbered sequence (Framework/CDR)

FASTA file

A1	A2	A3	A4	A5	A6	A7	A8
G	D	Q	V	E	Q	S	P
A9	A10	A11	A12	A13	A14	A15	A16
S	A	L	S	L	H	E	G
A17	A18	A19	A20	A21	A22	A23	A24
T	D	S	A	L	R	C	N
A25	A26	A27	A28	A29	A37	A38	A39
F	T	T	T	M	R	S	V
A40	A41	A42	A43	A44	A45	A46	A47
Q	W	F	R	Q	N	S	R
A48	A49	A50	A51	A52	A53	A54	A55
G	S	L	I	S	L	F	Y
A56	A57	A58	A64	A65	A66	A67	A68
L	A	S	G	T	K	E	N
A74	A75	A76	A77	A78	A79	A80	A81
G	R	L	K	S	A	F	D
A82	A83	A84	A84A	A85	A86	A87	A88
S	K	E	R	R	Y	S	T
A89	A90	A91	A92	A93	A94	A95	A96
L	H	I	R	D	A	Q	L
A97	A98	A99	A100	A101	A102	A103	A104
E	D	S	G	T	Y	F	C
A105	A106	A107	A108	A109	A110	A112	A113
A	A	E	A	S	S	G	A
A114	A115	A116	A117	A118	A119	A120	A121
W	Q	L	I	F	G	S	G
A122	A123	A124	A125	A126	A127	A128
T	Q	L	T	V	M	P

CDR Sequences:

Loop	Sequence	Predicted canonical form	CDR Length
CDRA3	AAEASSGAWQLI	None	12
CDRA2	LASGT	None	5
CDRA1	TTMRS	None	5

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IMGT-numbered structure	Link
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