Structure summary for 1hxm

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Structure information

Crystal Structure of a Human Vgamma9/Vdelta2 T Cell Receptor

ItemInfo
PDB1hxm
OrganismHOMO SAPIENS
MethodX-RAY DIFFRACTION
Resolution3.12Å
Number of TCRs4
Paired chains information

This PDB has 4 TCR(s).

A / B
TCR Details:
ItemInfo
VD chainA
VG chainB
VD IMGT detailsTRDV2/TRDJ1
VG IMGT detailsTRGV9/TRGJP
Specieshuman
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VDA FASTA file
D1 D2 D3 D4 D5 D6 D7 D8
A I E L V P E H
D9 D10 D11 D12 D13 D14 D15 D16
Q T V P V S I G
D17 D18 D19 D20 D21 D22 D23 D24
V P A T L R C S
D25 D26 D27 D28 D29 D30 D35 D36
M K G E A I G N
D37 D38 D39 D40 D41 D42 D43 D44
Y Y I N W Y R K
D45 D46 D47 D48 D49 D50 D51 D52
T Q G N T M T F
D53 D54 D55 D56 D57 D65 D66 D67
I Y R E K D I Y
D68 D69 D70 D71 D72 D74 D75 D76
G P G F K D N F
D77 D78 D79 D80 D81 D82 D83 D84
Q G D I D I A K
D85 D86 D87 D88 D89 D90 D91 D92
N L A V L K I L
D93 D94 D95 D96 D97 D98 D99 D100
A P S E R D E G
D101 D102 D103 D104 D105 D106 D107 D108
S Y Y C A C D T
D109 D110 D111 D111A D112B D112A D112 D113
L G M G G E Y T
D114 D115 D116 D117 D118 D119 D120 D121
D K L I F G K G
D122 D123 D124 D125 D126 D127 D128
T R V T V E P
VGB FASTA file
G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 G8
A G H L E Q P Q
G9 G10 G11 G12 G13 G14 G15 G16
I S S T K T L S
G17 G18 G19 G20 G21 G22 G23 G24
K T A R L E C V
G25 G26 G27 G28 G29 G30 G35 G36
V S G I T I S A
G37 G38 G39 G40 G41 G42 G43 G44
T S V Y W Y R E
G45 G46 G47 G48 G49 G50 G51 G52
R P G E V I Q F
G53 G54 G55 G56 G57 G58 G59 G63
L V S I S Y D G
G64 G65 G66 G67 G68 G69 G70 G71
T V R K E S G I
G72 G73 G74 G75 G76 G77 G78 G79
P S G K F E V D
G80 G81 G82 G83 G84 G85 G86 G87
R I P E T S T S
G88 G89 G90 G91 G92 G93 G94 G95
T L T I H N V E
G96 G97 G98 G99 G100 G101 G102 G103
K Q D I A T Y Y
G104 G105 G106 G107 G108 G109 G110 G111
C A L W E A Q Q
G111A G112A G112 G113 G114 G115 G116 G117
E L G K K I K V
G118 G119 G120 G121 G122 G123 G124 G125
F G P G T K L I
G126 G127
I T
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRD1GEAIGNYYNone8
CDRD2EKDNone3
CDRD3ACDTLGMGGEYTDKLINone16
CDRG1GITISATSNone8
CDRG2ISYDGTVNone7
CDRG3ALWEAQQELGKKIKVNone15

C / D
TCR Details:
ItemInfo
VD chainC
VG chainD
VD IMGT detailsTRDV2/TRDJ1
VG IMGT detailsTRGV9/TRGJP
Specieshuman
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VDC FASTA file
D1 D2 D3 D4 D5 D6 D7 D8
A I E L V P E H
D9 D10 D11 D12 D13 D14 D15 D16
Q T V P V S I G
D17 D18 D19 D20 D21 D22 D23 D24
V P A T L R C S
D25 D26 D27 D28 D29 D30 D35 D36
M K G E A I G N
D37 D38 D39 D40 D41 D42 D43 D44
Y Y I N W Y R K
D45 D46 D47 D48 D49 D50 D51 D52
T Q G N T M T F
D53 D54 D55 D56 D57 D65 D66 D67
I Y R E K D I Y
D68 D69 D70 D71 D72 D74 D75 D76
G P G F K D N F
D77 D78 D79 D80 D81 D82 D83 D84
Q G D I D I A K
D85 D86 D87 D88 D89 D90 D91 D92
N L A V L K I L
D93 D94 D95 D96 D97 D98 D99 D100
A P S E R D E G
D101 D102 D103 D104 D105 D106 D107 D108
S Y Y C A C D T
D109 D110 D111 D111A D112B D112A D112 D113
L G M G G E Y T
D114 D115 D116 D117 D118 D119 D120 D121
D K L I F G K G
D122 D123 D124 D125 D126 D127 D128
T R V T V E P
VGD FASTA file
G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 G8
A G H L E Q P Q
G9 G10 G11 G12 G13 G14 G15 G16
I S S T K T L S
G17 G18 G19 G20 G21 G22 G23 G24
K T A R L E C V
G25 G26 G27 G28 G29 G30 G35 G36
V S G I T I S A
G37 G38 G39 G40 G41 G42 G43 G44
T S V Y W Y R E
G45 G46 G47 G48 G49 G50 G51 G52
R P G E V I Q F
G53 G54 G55 G56 G57 G58 G59 G63
L V S I S Y D G
G64 G65 G66 G67 G68 G69 G70 G71
T V R K E S G I
G72 G73 G74 G75 G76 G77 G78 G79
P S G K F E V D
G80 G81 G82 G83 G84 G85 G86 G87
R I P E T S T S
G88 G89 G90 G91 G92 G93 G94 G95
T L T I H N V E
G96 G97 G98 G99 G100 G101 G102 G103
K Q D I A T Y Y
G104 G105 G106 G107 G108 G109 G110 G111
C A L W E A Q Q
G111A G112A G112 G113 G114 G115 G116 G117
E L G K K I K V
G118 G119 G120 G121 G122 G123 G124 G125
F G P G T K L I
G126 G127
I T
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRD1GEAIGNYYNone8
CDRD2EKDNone3
CDRD3ACDTLGMGGEYTDKLINone16
CDRG1GITISATSNone8
CDRG2ISYDGTVNone7
CDRG3ALWEAQQELGKKIKVNone15

E / F
TCR Details:
ItemInfo
VD chainE
VG chainF
VD IMGT detailsTRDV2/TRDJ1
VG IMGT detailsTRGV9/TRGJP
Specieshuman
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VDE FASTA file
D1 D2 D3 D4 D5 D6 D7 D8
A I E L V P E H
D9 D10 D11 D12 D13 D14 D15 D16
Q T V P V S I G
D17 D18 D19 D20 D21 D22 D23 D24
V P A T L R C S
D25 D26 D27 D28 D29 D30 D35 D36
M K G E A I G N
D37 D38 D39 D40 D41 D42 D43 D44
Y Y I N W Y R K
D45 D46 D47 D48 D49 D50 D51 D52
T Q G N T M T F
D53 D54 D55 D56 D57 D65 D66 D67
I Y R E K D I Y
D68 D69 D70 D71 D72 D74 D75 D76
G P G F K D N F
D77 D78 D79 D80 D81 D82 D83 D84
Q G D I D I A K
D85 D86 D87 D88 D89 D90 D91 D92
N L A V L K I L
D93 D94 D95 D96 D97 D98 D99 D100
A P S E R D E G
D101 D102 D103 D104 D105 D106 D107 D108
S Y Y C A C D T
D109 D110 D111 D111A D112B D112A D112 D113
L G M G G E Y T
D114 D115 D116 D117 D118 D119 D120 D121
D K L I F G K G
D122 D123 D124 D125 D126 D127 D128
T R V T V E P
VGF FASTA file
G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 G8
A G H L E Q P Q
G9 G10 G11 G12 G13 G14 G15 G16
I S S T K T L S
G17 G18 G19 G20 G21 G22 G23 G24
K T A R L E C V
G25 G26 G27 G28 G29 G30 G35 G36
V S G I T I S A
G37 G38 G39 G40 G41 G42 G43 G44
T S V Y W Y R E
G45 G46 G47 G48 G49 G50 G51 G52
R P G E V I Q F
G53 G54 G55 G56 G57 G58 G59 G63
L V S I S Y D G
G64 G65 G66 G67 G68 G69 G70 G71
T V R K E S G I
G72 G73 G74 G75 G76 G77 G78 G79
P S G K F E V D
G80 G81 G82 G83 G84 G85 G86 G87
R I P E T S T S
G88 G89 G90 G91 G92 G93 G94 G95
T L T I H N V E
G96 G97 G98 G99 G100 G101 G102 G103
K Q D I A T Y Y
G104 G105 G106 G107 G108 G109 G110 G111
C A L W E A Q Q
G111A G112A G112 G113 G114 G115 G116 G117
E L G K K I K V
G118 G119 G120 G121 G122 G123 G124 G125
F G P G T K L I
G126 G127
I T
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRD1GEAIGNYYNone8
CDRD2EKDNone3
CDRD3ACDTLGMGGEYTDKLINone16
CDRG1GITISATSNone8
CDRG2ISYDGTVNone7
CDRG3ALWEAQQELGKKIKVNone15

G / H
TCR Details:
ItemInfo
VD chainG
VG chainH
VD IMGT detailsTRDV2/TRDJ1
VG IMGT detailsTRGV9/TRGJP
Specieshuman
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VDG FASTA file
D1 D2 D3 D4 D5 D6 D7 D8
A I E L V P E H
D9 D10 D11 D12 D13 D14 D15 D16
Q T V P V S I G
D17 D18 D19 D20 D21 D22 D23 D24
V P A T L R C S
D25 D26 D27 D28 D29 D30 D35 D36
M K G E A I G N
D37 D38 D39 D40 D41 D42 D43 D44
Y Y I N W Y R K
D45 D46 D47 D48 D49 D50 D51 D52
T Q G N T M T F
D53 D54 D55 D56 D57 D65 D66 D67
I Y R E K D I Y
D68 D69 D70 D71 D72 D74 D75 D76
G P G F K D N F
D77 D78 D79 D80 D81 D82 D83 D84
Q G D I D I A K
D85 D86 D87 D88 D89 D90 D91 D92
N L A V L K I L
D93 D94 D95 D96 D97 D98 D99 D100
A P S E R D E G
D101 D102 D103 D104 D105 D106 D107 D108
S Y Y C A C D T
D109 D110 D111 D111A D112B D112A D112 D113
L G M G G E Y T
D114 D115 D116 D117 D118 D119 D120 D121
D K L I F G K G
D122 D123 D124 D125 D126 D127 D128
T R V T V E P
VGH FASTA file
G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 G8
A G H L E Q P Q
G9 G10 G11 G12 G13 G14 G15 G16
I S S T K T L S
G17 G18 G19 G20 G21 G22 G23 G24
K T A R L E C V
G25 G26 G27 G28 G29 G30 G35 G36
V S G I T I S A
G37 G38 G39 G40 G41 G42 G43 G44
T S V Y W Y R E
G45 G46 G47 G48 G49 G50 G51 G52
R P G E V I Q F
G53 G54 G55 G56 G57 G58 G59 G63
L V S I S Y D G
G64 G65 G66 G67 G68 G69 G70 G71
T V R K E S G I
G72 G73 G74 G75 G76 G77 G78 G79
P S G K F E V D
G80 G81 G82 G83 G84 G85 G86 G87
R I P E T S T S
G88 G89 G90 G91 G92 G93 G94 G95
T L T I H N V E
G96 G97 G98 G99 G100 G101 G102 G103
K Q D I A T Y Y
G104 G105 G106 G107 G108 G109 G110 G111
C A L W E A Q Q
G111A G112A G112 G113 G114 G115 G116 G117
E L G K K I K V
G118 G119 G120 G121 G122 G123 G124 G125
F G P G T K L I
G126 G127
I T
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRD1GEAIGNYYNone8
CDRD2EKDNone3
CDRD3ACDTLGMGGEYTDKLINone16
CDRG1GITISATSNone8
CDRG2ISYDGTVNone7
CDRG3ALWEAQQELGKKIKVNone15

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