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Crystal Structure of Human a6 TCR complexed with HLA-A2 Bound to altered Htlv-1 Tax Peptide P6a
Item | Info |
---|---|
PDB | 1qrn |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.8Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ24 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | LLFGYAVYV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASRPGLAGGRPEQY | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTTDSWGKLQ | A3-11-C | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 100.87° |
BC1 | 70.09° |
BA | -53.19° |
AC2 | 83.07° |
AC1 | 125.46° |
dc | 17.07Å |
Docking angle | 33.74° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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1ao7_ED | 101.22° | 70.44° | -53.35° | 82.76° | 124.53° | 17.28Å | 1.1 |
1qsf_ED | 100.59° | 70.43° | -53.95° | 81.96° | 125.01° | 16.83Å | 1.5 |
3pwp_ED | 99.46° | 70.45° | -54.01° | 82.97° | 125.10° | 17.00Å | 1.7 |
1qse_ED | 100.14° | 70.59° | -54.40° | 82.15° | 125.25° | 17.00Å | 1.8 |
3d3v_ED | 99.52° | 70.54° | -54.24° | 82.63° | 124.54° | 17.02Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.5 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.6 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.7 |
1cft_BA | 107.61° | 67.68° | -51.49° | 84.71° | 119.99° | 16.31Å | 9.3 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.7 |