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Structure of the HLA-E-Vmaprtlil/Kk50.4 TCR complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 2esv |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.6Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV14/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV26/TRAJ37 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | VMAPRTLIL |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-E*0101 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSQDRDTQY | None | 10 |
| CDRB2 | FVKESK | None | 6 |
| CDRB1 | SGHDN | None | 5 |
| CDRA3 | IVVRSSNTGKLI | None | 12 |
| CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 107.82° |
| BC1 | 72.93° |
| BA | -61.63° |
| AC2 | 93.92° |
| AC1 | 130.54° |
| dc | 17.31Å |
| Docking angle | 39.36° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 2.7 |
| 4z7v_FE | 111.26° | 73.06° | -61.69° | 93.39° | 131.70° | 17.14Å | 3.7 |
| 4z7v_HG | 111.21° | 73.03° | -62.36° | 92.92° | 131.88° | 17.12Å | 3.9 |
| 7byd_ED | 106.28° | 72.10° | -62.40° | 91.36° | 127.86° | 17.61Å | 4.2 |
| 7ndt_JI | 108.10° | 73.44° | -65.10° | 92.34° | 128.92° | 17.26Å | 4.2 |