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Crystal Structures of High affinity Human T-Cell Receptors Bound to PMHC Revealnative Diagonal Binding Geometry TCR Clone C5C1 complexed with MHC
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 2pye |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.3Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV21/TRAJ6 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | SLLMWITQC |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSYLGNTGELF | None | 12 |
| CDRB2 | SVGAGT | None | 6 |
| CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
| CDRA3 | AVRPLLDGTYIPT | None | 13 |
| CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
| CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 99.75° |
| BC1 | 70.55° |
| BA | -44.88° |
| AC2 | 88.10° |
| AC1 | 123.21° |
| dc | 17.40Å |
| Docking angle | 65.75° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2p5e_ED | 99.36° | 69.92° | -44.56° | 87.86° | 123.35° | 17.00Å | 0.9 |
| 2p5w_ED | 99.57° | 70.45° | -44.08° | 88.69° | 123.18° | 17.26Å | 1.0 |
| 2f53_ED | 98.66° | 70.55° | -45.38° | 89.09° | 123.08° | 17.05Å | 1.6 |
| 2bnq_ED | 99.08° | 70.19° | -46.99° | 87.94° | 123.48° | 17.00Å | 2.3 |
| 6q3s_ED | 98.41° | 70.06° | -44.57° | 89.80° | 124.11° | 17.21Å | 2.4 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5aum_AB | 108.02° | 70.08° | -43.21° | 85.51° | 119.94° | 16.13Å | 9.5 |