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the complex Between TCR Dmf4 and Human Class I MHC HLA-A2 with the Bound Mart-1(27-35) Nonameric Peptide
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 3qeq |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.59Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV10/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV35/TRAJ49 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | AAGIGILTV |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | AISEVGVGQPQH | None | 12 |
| CDRB2 | SYGVKD | None | 6 |
| CDRB1 | ENHRY | None | 5 |
| CDRA3 | AGGTGNQFY | None | 9 |
| CDRA2 | LYKAGEL | None | 7 |
| CDRA1 | SIFNT | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 103.07° |
| BC1 | 72.87° |
| BA | -62.60° |
| AC2 | 75.79° |
| AC1 | 121.69° |
| dc | 16.17Å |
| Docking angle | 44.35° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5tez_JI | 104.37° | 71.65° | -61.90° | 74.92° | 122.39° | 16.18Å | 2.2 |
| 3qh3_DC | 103.38° | 73.21° | -61.36° | 77.35° | 122.64° | 16.34Å | 2.3 |
| 8shi_JI | 103.32° | 71.33° | -63.29° | 76.98° | 120.64° | 16.23Å | 2.3 |
| 6uz1_ED | 103.15° | 73.02° | -61.74° | 74.37° | 123.46° | 16.24Å | 2.4 |
| 6uz1_JI | 103.24° | 72.55° | -60.29° | 76.44° | 122.02° | 16.41Å | 2.5 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.1 |
| 5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 7.1 |
| 4uil_HL | 109.73° | 69.62° | -65.41° | 77.88° | 119.52° | 16.24Å | 8.5 |
| 1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.5 |
| 2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 8.7 |