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1E6-a*0201-alwgpdpaaa complex, Triclinic
Item | Info |
---|---|
PDB | 3utt |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.6Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ALWGPDPAAA |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 110.75° |
BC1 | 78.06° |
BA | -63.30° |
AC2 | 78.03° |
AC1 | 121.78° |
dc | 16.28Å |
Docking angle | 47.23° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5c09_ED | 111.57° | 79.81° | -62.04° | 79.86° | 122.26° | 15.76Å | 3.0 |
5c0a_JI | 110.98° | 79.72° | -61.04° | 79.90° | 122.30° | 15.78Å | 3.5 |
5c09_JI | 111.34° | 79.36° | -61.57° | 81.44° | 122.47° | 15.87Å | 4.2 |
3utp_LK | 112.41° | 78.45° | -59.63° | 79.12° | 121.28° | 16.17Å | 4.2 |
5c07_ED | 112.10° | 80.10° | -60.76° | 80.35° | 122.08° | 15.77Å | 4.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 3.2 |
3wih_IM | 112.74° | 73.69° | -62.39° | 76.91° | 120.77° | 15.54Å | 5.2 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 5.2 |
1wz1_HL | 113.73° | 74.10° | -64.43° | 79.69° | 120.82° | 15.76Å | 5.5 |
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 5.5 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | J |
VA chain | I |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | H |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ALWGPDPAAA |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | F | G |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | J | FASTA file |
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VA | I | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 111.68° |
BC1 | 79.13° |
BA | -64.28° |
AC2 | 79.40° |
AC1 | 124.37° |
dc | 14.79Å |
Docking angle | 41.60° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5c09_ED | 111.57° | 79.81° | -62.04° | 79.86° | 122.26° | 15.76Å | 3.3 |
5c09_JI | 111.34° | 79.36° | -61.57° | 81.44° | 122.47° | 15.87Å | 4.1 |
5c0a_JI | 110.98° | 79.72° | -61.04° | 79.90° | 122.30° | 15.78Å | 4.1 |
5c07_ED | 112.10° | 80.10° | -60.76° | 80.35° | 122.08° | 15.77Å | 4.5 |
5c0a_ED | 110.76° | 79.27° | -60.64° | 81.16° | 122.52° | 15.82Å | 4.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3u7w_HL | 113.46° | 76.72° | -63.02° | 80.79° | 126.51° | 15.15Å | 4.1 |
4olw_HL | 114.43° | 76.42° | -62.67° | 79.88° | 126.11° | 15.24Å | 4.6 |
4olx_HL | 114.28° | 76.79° | -61.98° | 80.35° | 126.04° | 15.18Å | 4.6 |
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 4.7 |
4om1_HL | 114.35° | 76.76° | -61.47° | 80.48° | 125.74° | 15.22Å | 4.9 |