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the complex Between H27-14 TCR and HLA-A24 Bound to Hiv-1 Nef134-10(6L) Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 3vxs |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.8Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ12 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 |
Antigen Sequence | RYPLTLGWCF |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*2402 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSSWDTGELF | None | 11 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | AVRMDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.98° |
BC1 | 72.92° |
BA | -55.61° |
AC2 | 83.05° |
AC1 | 120.18° |
dc | 15.92Å |
Docking angle | 53.68° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4jfh_ED | 100.12° | 72.76° | -55.04° | 82.61° | 121.25° | 15.95Å | 1.6 |
6mss_BA | 101.09° | 73.12° | -55.20° | 81.96° | 121.34° | 16.03Å | 1.7 |
4jfd_ED | 100.82° | 74.44° | -56.42° | 83.45° | 121.04° | 15.72Å | 2.0 |
4jff_ED | 100.97° | 74.58° | -56.50° | 83.52° | 121.39° | 15.61Å | 2.3 |
4jfe_ED | 101.11° | 74.96° | -56.38° | 83.55° | 120.68° | 15.65Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.0 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.2 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 8.2 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 8.4 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.1 |