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Crystal Structure of C12C TCR-Ha B2705-Kk10
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4g8g |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.4Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV14/TRAJ21 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 |
| Antigen Sequence | KRWIILGLNK |
| Antigen Length | 10 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASREGLGGTEAF | None | 12 |
| CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
| CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
| CDRA3 | AMRDLRDNFNKFY | None | 13 |
| CDRA2 | QGSYDEQN | None | 8 |
| CDRA1 | TSDQSYG | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 94.99° |
| BC1 | 74.04° |
| BA | -60.35° |
| AC2 | 87.24° |
| AC1 | 120.94° |
| dc | 15.58Å |
| Docking angle | 41.19° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4g9f_ED | 95.68° | 74.49° | -59.82° | 87.57° | 121.05° | 15.92Å | 1.1 |
| 3qjh_BA | 95.35° | 72.28° | -61.51° | 81.70° | 120.10° | 16.33Å | 6.0 |
| 3qib_DC | 96.76° | 72.09° | -61.86° | 81.15° | 122.15° | 16.00Å | 6.9 |
| 8gvb_BA | 99.60° | 73.97° | -56.72° | 82.64° | 122.55° | 15.61Å | 7.6 |
| 3qjh_DC | 95.16° | 71.23° | -62.76° | 80.66° | 120.31° | 16.37Å | 7.6 |