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Crystal Structure of C12C TCR-Hlab2705-Kk10-L6M
Item | Info |
---|---|
PDB | 4g9f |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.9Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV14/TRAJ21 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 |
Antigen Sequence | KRWIIMGLNK |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASREGLGGTEAF | None | 12 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AMRDLRDNFNKFY | None | 13 |
CDRA2 | QGSYDEQN | None | 8 |
CDRA1 | TSDQSYG | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 95.68° |
BC1 | 74.49° |
BA | -59.82° |
AC2 | 87.57° |
AC1 | 121.05° |
dc | 15.92Å |
Docking angle | 41.59° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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4g8g_ED | 94.99° | 74.04° | -60.35° | 87.24° | 120.94° | 15.58Å | 1.1 |
3qjh_BA | 95.35° | 72.28° | -61.51° | 81.70° | 120.10° | 16.33Å | 6.6 |
8gvg_BA | 100.75° | 74.24° | -56.89° | 83.92° | 122.48° | 15.74Å | 7.1 |
6tmo_ED | 100.72° | 75.28° | -56.86° | 83.49° | 121.07° | 15.58Å | 7.2 |
8gvb_BA | 99.60° | 73.97° | -56.72° | 82.64° | 122.55° | 15.61Å | 7.2 |