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the complex Between High affinity TCR Dmf5(alpha-D26Y,Beta-L98W) and Human Class I MHC HLA-A2 with the Bound Mart-1(26-35)(a27L) Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 4l3e |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.557Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ23 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ELAGIGILTV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSWSFGTEAF | None | 11 |
CDRB2 | SNTAGT | None | 6 |
CDRB1 | MRHNA | None | 5 |
CDRA3 | AVNFGGGKLI | A3-10-E | 10 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | YRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.62° |
BC1 | 70.06° |
BA | -53.59° |
AC2 | 79.99° |
AC1 | 121.11° |
dc | 16.22Å |
Docking angle | 32.61° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6dkp_ED | 105.14° | 69.86° | -53.18° | 81.23° | 121.48° | 16.13Å | 1.5 |
6am5_ED | 105.95° | 69.43° | -54.24° | 78.09° | 121.92° | 16.27Å | 2.3 |
6amu_ED | 105.30° | 68.73° | -54.79° | 79.13° | 122.23° | 16.29Å | 2.3 |
7pdw_BA | 105.93° | 70.35° | -55.27° | 79.94° | 122.76° | 16.58Å | 2.4 |
3qdg_ED | 105.95° | 69.72° | -55.67° | 78.72° | 121.20° | 16.13Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 3.4 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 3.7 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 4.5 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 5.1 |
1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 5.1 |