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Pf6-M1-HLA-A2
Item | Info |
---|---|
PDB | 5euo |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.1Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV27/TRAJ37 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | J |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
Antigen Sequence | GILGFVFTL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | E | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSIRSSYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AGAIGPSNTGKLI | None | 13 |
CDRA2 | VVTGGEV | None | 7 |
CDRA1 | SVFSS | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.03° |
BC1 | 68.02° |
BA | -49.41° |
AC2 | 82.32° |
AC1 | 122.09° |
dc | 17.65Å |
Docking angle | 65.21° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4e42_DC | 101.69° | 69.47° | -52.06° | 81.97° | 124.55° | 16.37Å | 4.2 |
4e42_BA | 100.75° | 70.98° | -53.41° | 81.65° | 121.31° | 16.13Å | 5.3 |
1ao7_ED | 101.22° | 70.44° | -53.35° | 82.76° | 124.53° | 17.28Å | 5.3 |
2ian_JI | 100.91° | 66.48° | -48.43° | 82.81° | 127.05° | 16.72Å | 5.4 |
1qrn_ED | 100.87° | 70.09° | -53.19° | 83.07° | 125.46° | 17.07Å | 5.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1cft_BA | 107.61° | 67.68° | -51.49° | 84.71° | 119.99° | 16.31Å | 7.7 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.0 |
1cfn_BA | 107.76° | 67.31° | -50.48° | 85.90° | 120.10° | 16.45Å | 8.1 |
1bog_BA | 107.87° | 66.84° | -51.21° | 85.76° | 120.10° | 16.36Å | 8.3 |
1hh9_BA | 107.79° | 65.41° | -51.30° | 86.08° | 120.14° | 16.39Å | 8.7 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | H |
VA chain | G |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV27/TRAJ37 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | I |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
Antigen Sequence | GILGFVFTL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | H | FASTA file |
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VA | G | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSIRSSYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AGAIGPSNTGKLI | None | 13 |
CDRA2 | VVTGGEV | None | 7 |
CDRA1 | SVFSS | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 99.86° |
BC1 | 68.43° |
BA | -49.00° |
AC2 | 82.87° |
AC1 | 122.72° |
dc | 17.43Å |
Docking angle | 66.14° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4e42_DC | 101.69° | 69.47° | -52.06° | 81.97° | 124.55° | 16.37Å | 4.4 |
2f54_LK | 97.77° | 70.00° | -49.95° | 86.54° | 123.25° | 16.87Å | 4.7 |
2ian_JI | 100.91° | 66.48° | -48.43° | 82.81° | 127.05° | 16.72Å | 4.9 |
2bnr_ED | 99.46° | 70.52° | -47.45° | 87.20° | 123.24° | 16.92Å | 5.1 |
1ao7_ED | 101.22° | 70.44° | -53.35° | 82.76° | 124.53° | 17.28Å | 5.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1cft_BA | 107.61° | 67.68° | -51.49° | 84.71° | 119.99° | 16.31Å | 8.9 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 9.0 |
1cfn_BA | 107.76° | 67.31° | -50.48° | 85.90° | 120.10° | 16.45Å | 9.1 |
1bog_BA | 107.87° | 66.84° | -51.21° | 85.76° | 120.10° | 16.36Å | 9.4 |
1hh9_BA | 107.79° | 65.41° | -51.30° | 86.08° | 120.14° | 16.39Å | 9.8 |