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TCR F50 Recgonizing M1-HLA-A2
Item | Info |
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PDB | 5tez |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.7Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | J |
VA chain | I |
VB IMGT details | TRBV27/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV13/TRAJ54 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
Antigen Sequence | GILGFVFTL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | J | FASTA file |
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VA | I | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLLGGWSEAF | None | 12 |
CDRB2 | SMNVEV | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AASFIIQGAQKLV | None | 13 |
CDRA2 | IRSNVGE | None | 7 |
CDRA1 | DSASNY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.37° |
BC1 | 71.65° |
BA | -61.90° |
AC2 | 74.92° |
AC1 | 122.39° |
dc | 16.18Å |
Docking angle | 34.42° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3gsn_BA | 104.39° | 70.48° | -61.77° | 74.25° | 122.78° | 16.81Å | 1.5 |
4x6d_HG | 106.02° | 72.33° | -61.93° | 75.96° | 122.76° | 16.56Å | 2.1 |
3qeq_ED | 103.07° | 72.87° | -62.60° | 75.79° | 121.69° | 16.17Å | 2.2 |
7f5k_DC | 106.07° | 71.79° | -62.77° | 75.29° | 123.23° | 16.79Å | 2.2 |
6uz1_ED | 103.15° | 73.02° | -61.74° | 74.37° | 123.46° | 16.24Å | 2.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 4.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 7.3 |
4uil_HL | 109.73° | 69.62° | -65.41° | 77.88° | 119.52° | 16.24Å | 7.9 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 8.0 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.2 |