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TCR589 in complex with Hiv(Pol448-456)/HLA-B35
Item | Info |
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PDB | 6bj2 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.35Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV5/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV19/TRAJ53 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 |
Antigen Sequence | IPLTEEAEL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*3501 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSFRGGKTQY | None | 11 |
CDRB2 | YYREEE | None | 6 |
CDRB1 | SGHNT | None | 5 |
CDRA3 | ALSHNSGGSNYKLT | None | 14 |
CDRA2 | RNSFDEQN | None | 8 |
CDRA1 | TRDTTYY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 103.23° |
BC1 | 74.84° |
BA | -63.07° |
AC2 | 77.97° |
AC1 | 123.12° |
dc | 15.83Å |
Docking angle | 41.85° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4pjh_HG | 103.29° | 73.34° | -63.14° | 79.06° | 123.01° | 16.41Å | 1.9 |
4pjd_HG | 103.27° | 73.44° | -64.37° | 77.96° | 123.23° | 16.53Å | 2.0 |
5u1r_ED | 104.10° | 73.42° | -63.68° | 78.68° | 123.26° | 16.55Å | 2.0 |
6pug_HG | 104.46° | 73.79° | -63.36° | 78.77° | 122.39° | 16.54Å | 2.1 |
4pji_FE | 103.81° | 73.74° | -64.59° | 78.25° | 123.26° | 16.62Å | 2.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.2 |
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 7.6 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 7.7 |
3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 7.8 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.1 |