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the complex Between TCR a7B2 and Human Class I MHC HLA-A0201-Wt1 with the Bound Rmfpnapyl Peptide.
Item | Info |
---|---|
PDB | 6rsy |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.95Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ40 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | RMFPNAPYL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLGFGRDVMR | None | 12 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | IGGGTTSGTYKYI | None | 13 |
CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
CDRA1 | TVDPNEY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.28° |
BC1 | 72.38° |
BA | -53.55° |
AC2 | 91.75° |
AC1 | 125.59° |
dc | 16.63Å |
Docking angle | 52.64° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 4.3 |
3dx9_DC | 103.97° | 70.05° | -51.49° | 90.65° | 128.47° | 17.29Å | 4.5 |
4ozg_HG | 102.14° | 72.61° | -57.16° | 93.52° | 129.20° | 17.54Å | 5.6 |
4onh_BA | 106.40° | 71.96° | -51.81° | 87.71° | 127.93° | 17.28Å | 5.9 |
7dzm_DE | 104.92° | 71.39° | -51.44° | 93.90° | 130.79° | 17.55Å | 6.4 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.4 |
Item | Info |
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VB chain | J |
VA chain | I |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ40 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | H |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | RMFPNAPYL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | F | G |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | J | FASTA file |
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VA | I | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLGFGRDVMR | None | 12 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | IGGGTTSGTYKYI | None | 13 |
CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
CDRA1 | TVDPNEY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.21° |
BC1 | 72.00° |
BA | -53.93° |
AC2 | 91.18° |
AC1 | 125.77° |
dc | 16.66Å |
Docking angle | 53.39° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 4.1 |
3dx9_DC | 103.97° | 70.05° | -51.49° | 90.65° | 128.47° | 17.29Å | 4.3 |
4ozg_HG | 102.14° | 72.61° | -57.16° | 93.52° | 129.20° | 17.54Å | 5.5 |
4onh_BA | 106.40° | 71.96° | -51.81° | 87.71° | 127.93° | 17.28Å | 5.6 |
4c56_BA | 102.63° | 68.94° | -53.41° | 85.76° | 124.42° | 16.28Å | 6.4 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.0 |