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Silv44 T Cell Receptor Bound to HLA-A2 Presenting Gp100T2M Peptide (Imdqvpfsv)
Item | Info |
---|---|
PDB | 6vm8 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.41Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV8/TRAJ29 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSITLSSYNEQF | None | 13 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AVNARRNTPLV | None | 11 |
CDRA2 | YFSGDPLV | None | 8 |
CDRA1 | YGGTVN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.35° |
BC1 | 69.91° |
BA | -57.04° |
AC2 | 74.31° |
AC1 | 124.38° |
dc | 17.25Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6vm7_ED | 102.44° | 70.11° | -57.96° | 73.60° | 124.55° | 17.41Å | 1.6 |
3qdm_ED | 102.30° | 71.90° | -57.58° | 76.51° | 124.15° | 16.66Å | 3.2 |
6tro_ED | 101.60° | 73.22° | -56.62° | 75.68° | 125.70° | 17.35Å | 3.9 |
6vtc_BA | 104.26° | 70.42° | -59.69° | 74.76° | 124.13° | 17.34Å | 4.0 |
6zkw_ED | 103.08° | 69.33° | -56.66° | 75.38° | 120.94° | 16.63Å | 4.1 |