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T Cell Receptor-P53-HLA-A2 complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 6vrm |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.61Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ13 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | HMTEVVRHC |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSEGLWQVGDEQY | None | 14 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
CDRA3 | VVQPGGYQKVT | None | 11 |
CDRA2 | VYSSG | None | 5 |
CDRA1 | NSASQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.62° |
BC1 | 72.56° |
BA | -58.21° |
AC2 | 82.07° |
AC1 | 124.91° |
dc | 17.13Å |
Docking angle | 51.43° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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2e7l_DA | 103.46° | 72.58° | -58.01° | 82.08° | 125.57° | 16.65Å | 0.9 |
6vth_BA | 102.74° | 71.64° | -57.94° | 81.95° | 125.13° | 17.18Å | 1.3 |
5jzi_JI | 103.64° | 71.67° | -57.46° | 81.83° | 125.91° | 16.54Å | 1.7 |
3e3q_NM | 103.85° | 71.84° | -59.79° | 81.45° | 125.08° | 16.85Å | 1.9 |
5yxn_BA | 103.61° | 72.46° | -58.14° | 80.52° | 125.75° | 16.26Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.1 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.3 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 7.4 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 7.6 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 7.7 |