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T Cell Receptor-P53-HLA-A2 complex
Item | Info |
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PDB | 6vrn |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.46Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV10/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV38/TRAJ28 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | HMTEVVRHC |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AISELVTGDSPLH | None | 13 |
CDRB2 | SYGVKD | None | 6 |
CDRB1 | ENHRY | None | 5 |
CDRA3 | AFMGYSGAGSYQLT | None | 14 |
CDRA2 | QEAYKQQN | None | 8 |
CDRA1 | TSENNYY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 105.26° |
BC1 | 74.47° |
BA | -56.51° |
AC2 | 79.15° |
AC1 | 123.98° |
dc | 16.25Å |
Docking angle | 33.73° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5wkf_ED | 105.05° | 74.18° | -55.82° | 79.79° | 123.90° | 15.76Å | 1.1 |
5wkf_JI | 104.85° | 73.91° | -55.54° | 78.85° | 123.53° | 15.85Å | 1.4 |
7n1f_ED | 104.75° | 73.39° | -56.54° | 80.18° | 124.07° | 16.16Å | 1.6 |
7rtr_ED | 105.39° | 73.05° | -56.94° | 79.32° | 123.14° | 16.23Å | 1.7 |
5wkh_JI | 104.42° | 73.63° | -57.81° | 79.10° | 123.79° | 15.88Å | 1.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 4.8 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 6.7 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.7 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 7.3 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 7.4 |