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Crystal Structure of inha:01 TCR in complex with HLA-E Bound to inha (53-61)
Item | Info |
---|---|
PDB | 6zkw |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.26Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ15 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV |
Antigen Sequence | RLPAKAPLL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-E*0103 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSYSIRGSRGEQF | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTNQAGTALI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.08° |
BC1 | 69.33° |
BA | -56.66° |
AC2 | 75.38° |
AC1 | 120.94° |
dc | 16.63Å |
Docking angle | 60.16° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6zky_ED | 102.45° | 69.15° | -57.45° | 75.09° | 120.34° | 16.56Å | 1.2 |
6zkz_ED | 103.83° | 69.43° | -57.13° | 74.09° | 120.53° | 16.35Å | 1.6 |
6zkx_ED | 104.13° | 69.40° | -56.91° | 73.89° | 121.16° | 16.57Å | 1.9 |
3qdj_ED | 105.56° | 69.36° | -56.86° | 77.81° | 120.75° | 16.13Å | 3.5 |
6vqo_ED | 101.63° | 71.54° | -58.26° | 77.26° | 121.24° | 16.62Å | 3.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 7.0 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 9.2 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 9.3 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 9.4 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 9.7 |