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Crystal Structure of inha:01 TCR in complex with HLA-E (Y84C) Bound to inha (53-61 Gcg)
Item | Info |
---|---|
PDB | 6zkx |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.17Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ15 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV |
Antigen Sequence | RLPAKAPLLGCG |
Antigen Length | 12 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-E*0103 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSYSIRGSRGEQF | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTNQAGTALI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.13° |
BC1 | 69.40° |
BA | -56.91° |
AC2 | 73.89° |
AC1 | 121.16° |
dc | 16.57Å |
Docking angle | 60.62° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6zkz_ED | 103.83° | 69.43° | -57.13° | 74.09° | 120.53° | 16.35Å | 0.8 |
6zkw_ED | 103.08° | 69.33° | -56.66° | 75.38° | 120.94° | 16.63Å | 1.9 |
6zky_ED | 102.45° | 69.15° | -57.45° | 75.09° | 120.34° | 16.56Å | 2.3 |
6vm7_ED | 102.44° | 70.11° | -57.96° | 73.60° | 124.55° | 17.41Å | 4.1 |
3qdj_ED | 105.56° | 69.36° | -56.86° | 77.81° | 120.75° | 16.13Å | 4.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 7.9 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 8.3 |
5kte_HL | 112.24° | 69.79° | -60.09° | 77.74° | 119.92° | 16.52Å | 9.6 |