Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
Crystal Structure of the Cross-Restricted T18a TCR and Hlab8101 Bound to Hiv-1 Gag Tl9 Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7dzm |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.25Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | D |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ39 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 |
Antigen Sequence | TPQDLNTML |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*8101 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VB | D | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VA | E | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLGIDAIY | None | 10 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHNS | None | 5 |
CDRA3 | IVRGLNNAGNMLT | None | 13 |
CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.92° |
BC1 | 71.39° |
BA | -51.44° |
AC2 | 93.90° |
AC1 | 130.79° |
dc | 17.55Å |
Docking angle | 43.72° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7dzn_DE | 104.31° | 71.30° | -51.03° | 94.04° | 131.03° | 17.63Å | 0.8 |
4gg8_FE | 107.56° | 70.66° | -50.66° | 94.18° | 132.57° | 17.45Å | 3.4 |
4gg8_BA | 107.54° | 70.62° | -50.55° | 94.37° | 132.63° | 17.48Å | 3.4 |
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 3.9 |
3dx9_DC | 103.97° | 70.05° | -51.49° | 90.65° | 128.47° | 17.29Å | 4.3 |