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Crystal Structure of B17-C1 TCR-H2Db
Item | Info |
---|---|
PDB | 7jwj |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.251Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV17/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV4/TRAJ37 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
Antigen Sequence | ASNENMETM |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | H2-D1b |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSRGTIHSNTEVF | None | 14 |
CDRB2 | YYDKIL | None | 6 |
CDRB1 | MNHDT | None | 5 |
CDRA3 | AAVTGNTGKLI | None | 11 |
CDRA2 | LASGT | None | 5 |
CDRA1 | TTMRS | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 98.39° |
BC1 | 74.68° |
BA | -44.94° |
AC2 | 86.04° |
AC1 | 123.10° |
dc | 15.83Å |
Docking angle | 14.48° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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2pye_ED | 99.75° | 70.55° | -44.88° | 88.10° | 123.21° | 17.40Å | 5.1 |
5brz_ED | 101.38° | 70.91° | -46.16° | 86.76° | 123.99° | 16.21Å | 5.1 |
5bs0_ED | 101.94° | 71.33° | -45.62° | 87.50° | 124.02° | 16.22Å | 5.2 |
2bnr_ED | 99.46° | 70.52° | -47.45° | 87.20° | 123.24° | 16.92Å | 5.2 |
2p5e_ED | 99.36° | 69.92° | -44.56° | 87.86° | 123.35° | 17.00Å | 5.3 |