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Crystal Structure of B17-C1 TCR-H2Db
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7jwj |
| Organism | MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 3.251Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV17/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ37 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen Sequence | ASNENMETM |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | mouse |
| MHC IMGT details | H2-D1b |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSRGTIHSNTEVF | None | 14 |
| CDRB2 | YYDKIL | None | 6 |
| CDRB1 | MNHDT | None | 5 |
| CDRA3 | AAVTGNTGKLI | None | 11 |
| CDRA2 | LASGT | None | 5 |
| CDRA1 | TTMRS | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 98.39° |
| BC1 | 74.68° |
| BA | -44.94° |
| AC2 | 86.04° |
| AC1 | 123.10° |
| dc | 15.83Å |
| Docking angle | 14.48° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2pye_ED | 99.75° | 70.55° | -44.88° | 88.10° | 123.21° | 17.40Å | 5.1 |
| 5brz_ED | 101.38° | 70.91° | -46.16° | 86.76° | 123.99° | 16.21Å | 5.1 |
| 5bs0_ED | 101.94° | 71.33° | -45.62° | 87.50° | 124.02° | 16.22Å | 5.2 |
| 2bnr_ED | 99.46° | 70.52° | -47.45° | 87.20° | 123.24° | 16.92Å | 5.2 |
| 2p5e_ED | 99.36° | 69.92° | -44.56° | 87.86° | 123.35° | 17.00Å | 5.3 |