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Human MHC Class I, a24 allele Presenting Qlprlfpll, complex with 4C6 TCR
Item | Info |
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PDB | 7nme |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.2Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV5/TRAJ37 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | QLPRLFPLL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*2402 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLHHEQY | None | 9 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | AEPSGNTGKLI | None | 11 |
CDRA2 | IFSNMDM | None | 7 |
CDRA1 | DSSSTY | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 101.80° |
BC1 | 74.80° |
BA | -54.27° |
AC2 | 81.80° |
AC1 | 120.98° |
dc | 16.24Å |
Docking angle | 36.10° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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7nmg_ED | 101.49° | 74.29° | -55.01° | 81.27° | 120.91° | 16.16Å | 1.1 |
7nmf_ED | 102.41° | 74.13° | -54.73° | 81.83° | 121.62° | 16.17Å | 1.2 |
6r2l_ED | 100.19° | 75.35° | -54.43° | 81.77° | 120.33° | 15.96Å | 1.8 |
6mra_BA | 100.44° | 73.77° | -54.63° | 82.11° | 122.00° | 15.88Å | 2.1 |
6mss_BA | 101.09° | 73.12° | -55.20° | 81.96° | 121.34° | 16.03Å | 2.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 6.7 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 7.6 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 8.4 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 8.9 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 9.1 |