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Structure of a Fully assembled T-Cell Receptor Engaging a Tumor-associated Peptide-MHC I
Item | Info |
---|---|
PDB | 7phr |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | ELECTRON MICROSCOPY |
Resolution | NA |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV17/TRAJ14 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | YLEPGPVTV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | H | L |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSWGAPYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SWAQGD | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | ATDGSTPMQ | None | 9 |
CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
CDRA1 | TSINN | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.84° |
BC1 | 68.79° |
BA | -60.97° |
AC2 | 80.25° |
AC1 | 128.63° |
dc | 16.90Å |
Docking angle | 43.77° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3tpu_HG | 104.60° | 69.86° | -61.37° | 80.13° | 129.21° | 17.65Å | 2.3 |
3tpu_BA | 104.73° | 70.40° | -61.30° | 80.06° | 128.52° | 17.68Å | 2.6 |
3tpu_DC | 105.89° | 70.23° | -62.13° | 79.88° | 129.22° | 17.56Å | 3.7 |
7zt8_ED | 102.98° | 70.77° | -62.30° | 81.33° | 125.87° | 16.92Å | 3.8 |
3tpu_NM | 106.04° | 70.98° | -62.06° | 80.38° | 128.83° | 17.57Å | 4.1 |