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Crystal Structure of Engineered TCR (756) complexed to HLA-A*02:01 Presenting Mage-a10 9-Mer Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7qpj |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.54Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ5 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | E |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GLYDGMEHL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSFATEAF | None | 9 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHNY | None | 5 |
CDRA3 | AVRGTGRRALT | None | 11 |
CDRA2 | IYANGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSSS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.05° |
BC1 | 71.98° |
BA | -56.60° |
AC2 | 79.00° |
AC1 | 123.72° |
dc | 16.44Å |
Docking angle | 32.15° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7rtr_ED | 105.39° | 73.05° | -56.94° | 79.32° | 123.14° | 16.23Å | 1.4 |
7pbe_JI | 106.09° | 72.32° | -55.89° | 79.51° | 124.71° | 16.52Å | 1.7 |
7pbe_ED | 106.19° | 72.72° | -57.80° | 79.41° | 123.62° | 16.51Å | 1.9 |
7n1f_ED | 104.75° | 73.39° | -56.54° | 80.18° | 124.07° | 16.16Å | 1.9 |
5wkh_ED | 104.74° | 73.45° | -57.91° | 78.59° | 123.55° | 15.95Å | 2.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 5.2 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 5.9 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.0 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 6.6 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 6.7 |