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the complex Between Til 1383I TCR and Human Class I MHC HLA-A2 with the Bound Tyrosinase(369-377)(N371D) Nonameric Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7rk7 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.54Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV10/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV4/TRAJ42 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | YMDGTMSQV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AISPTEEGGLIFPGNTIY | None | 18 |
CDRB2 | SYGVKD | None | 6 |
CDRB1 | ENHRY | None | 5 |
CDRA3 | LVALNYGGSQGNLI | None | 14 |
CDRA2 | GYKTK | None | 5 |
CDRA1 | NIATNDY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 111.22° |
BC1 | 70.45° |
BA | -56.86° |
AC2 | 83.21° |
AC1 | 131.56° |
dc | 17.65Å |
Docking angle | 81.34° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5d2n_ED | 110.19° | 72.39° | -59.01° | 86.80° | 130.58° | 17.29Å | 4.8 |
7rrg_ED | 110.74° | 73.78° | -58.09° | 86.50° | 131.23° | 16.91Å | 4.9 |
5d2n_FC | 110.14° | 72.01° | -59.58° | 87.06° | 130.65° | 17.38Å | 5.2 |
6at6_BA | 108.59° | 68.53° | -61.44° | 83.47° | 134.75° | 18.18Å | 6.5 |
5wki_ED | 105.92° | 71.26° | -58.68° | 85.56° | 129.52° | 17.34Å | 6.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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5mvz_AB | 112.73° | 69.79° | -54.63° | 83.84° | 125.71° | 16.42Å | 6.6 |
2dtg_CD | 112.45° | 70.45° | -56.63° | 81.76° | 125.38° | 16.00Å | 6.7 |
4hfu_HL | 112.36° | 71.78° | -58.26° | 83.56° | 125.23° | 16.51Å | 6.8 |
4rgm_CB | 114.32° | 69.42° | -54.82° | 84.03° | 126.25° | 15.93Å | 6.8 |
5i9q_HL | 112.63° | 70.30° | -55.63° | 83.99° | 124.98° | 16.79Å | 6.9 |