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Crystal Structure of Human 0606T1-2 TCR Bound to HLA-A*03:01 in complex with a Mutant Pik3Ca Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7rrg |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.12Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV11/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV4/TRAJ9 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLVAETYEQY | None | 12 |
CDRB2 | FQNNGV | None | 6 |
CDRB1 | SGHAT | None | 5 |
CDRA3 | LVGGAYTGGFKTI | None | 13 |
CDRA2 | GYKTK | None | 5 |
CDRA1 | NIATNDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 110.74° |
BC1 | 73.78° |
BA | -58.09° |
AC2 | 86.50° |
AC1 | 131.23° |
dc | 16.91Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5d2n_ED | 110.19° | 72.39° | -59.01° | 86.80° | 130.58° | 17.29Å | 1.9 |
5d2n_FC | 110.14° | 72.01° | -59.58° | 87.06° | 130.65° | 17.38Å | 2.6 |
4z7u_HG | 108.35° | 73.51° | -58.43° | 88.99° | 131.96° | 17.40Å | 3.6 |
4z7u_FE | 107.76° | 73.67° | -57.94° | 88.53° | 131.88° | 17.47Å | 3.7 |
7rk7_ED | 111.22° | 70.45° | -56.86° | 83.21° | 131.56° | 17.65Å | 4.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4xvt_HL | 115.50° | 74.82° | -56.42° | 84.75° | 127.14° | 15.62Å | 6.9 |
4hfu_HL | 112.36° | 71.78° | -58.26° | 83.56° | 125.23° | 16.51Å | 7.2 |
4xvs_HL | 115.53° | 75.40° | -59.24° | 84.30° | 126.77° | 16.08Å | 7.2 |
3ngb_JK | 113.58° | 76.57° | -58.29° | 82.12° | 126.52° | 15.32Å | 7.7 |
2w60_AB | 111.29° | 72.16° | -56.81° | 86.34° | 123.74° | 16.34Å | 7.8 |