Crystal Structure of Broadly Neutralizing antibody C05 Bound to H3 influenza Hemagglutinin
| PDB | 4fqr |
| Species | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 4.1Å |
| Number of Fvs | 12 |
| In complex | True |
| Light chain type | Kappa |
| Has constant region | True |
|
|
Display options: |
This PDB has 12 Fv(s).
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | a |
| Light chain | b |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | A |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.85° |
| HC1 | 70.46° |
| HC2 | 116.12° |
| LC1 | 119.21° |
| LC2 | 83.62° |
| dc | 16.38Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | w |
| Light chain | x |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | W |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.99° |
| HC1 | 70.54° |
| HC2 | 116.29° |
| LC1 | 119.35° |
| LC2 | 83.53° |
| dc | 16.32Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | m |
| Light chain | n |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | M |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -61.25° |
| HC1 | 70.41° |
| HC2 | 115.99° |
| LC1 | 119.27° |
| LC2 | 83.45° |
| dc | 16.27Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | e |
| Light chain | f |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | E |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.98° |
| HC1 | 70.57° |
| HC2 | 116.27° |
| LC1 | 119.45° |
| LC2 | 83.66° |
| dc | 16.29Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | s |
| Light chain | t |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | S |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.85° |
| HC1 | 70.65° |
| HC2 | 116.14° |
| LC1 | 119.2° |
| LC2 | 83.77° |
| dc | 16.32Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | q |
| Light chain | r |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | Q |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.74° |
| HC1 | 70.61° |
| HC2 | 116.18° |
| LC1 | 119.36° |
| LC2 | 83.72° |
| dc | 16.33Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | k |
| Light chain | l |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | K |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.88° |
| HC1 | 70.6° |
| HC2 | 116.12° |
| LC1 | 119.27° |
| LC2 | 83.71° |
| dc | 16.33Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | i |
| Light chain | j |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | I |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.88° |
| HC1 | 70.75° |
| HC2 | 116.08° |
| LC1 | 119.1° |
| LC2 | 83.89° |
| dc | 16.35Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | u |
| Light chain | v |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | U |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -61.17° |
| HC1 | 70.55° |
| HC2 | 116.14° |
| LC1 | 119.13° |
| LC2 | 83.36° |
| dc | 16.26Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | o |
| Light chain | p |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | O |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -60.95° |
| HC1 | 70.68° |
| HC2 | 116.28° |
| LC1 | 119.22° |
| LC2 | 83.7° |
| dc | 16.3Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | c |
| Light chain | d |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | C |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -61.05° |
| HC1 | 70.62° |
| HC2 | 116.0° |
| LC1 | 119.12° |
| LC2 | 83.65° |
| dc | 16.27Å |
| Fv Details | |
|---|---|
| Heavy chain | g |
| Light chain | h |
| Heavy subgroup | IGHV3 |
| Light subgroup | IGKV1 |
| Species | HOMO SAPIENS |
| In complex? | True |
| scFv? | False |
| Has constant domain? | True |
| Numbered Sequences (chothia) |
|---|
Heavy chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 31A | 31B | 31C | 31D | 31E | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 52A | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 82A | 82B | 82C | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 100A | 100B | 100C | 100D | 100E | 100F | 100G | 100H | 100I | 100J | 100K | 100L | 100M | 100N | 100O | 100P | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E | V | Q | L | Q | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | E | S | L | R | L | S | C | V | G | S | G | S | S | F | G | E | S | T | L | S | Y | Y | A | V | S | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | S | I | I | N | A | G | G | G | D | I | D | Y | A | D | S | V | E | G | R | F | T | I | S | R | D | N | S | K | E | T | L | Y | L | Q | M | T | N | L | R | V | E | D | T | G | V | Y | Y | C | A | K | H | M | S | M | Q | Q | V | V | S | A | G | W | E | R | A | D | L | V | G | D | A | F | D | V | W | G | Q | G | T | M | V | T | V | S | S |
Light chain
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D | I | Q | L | T | Q | S | P | S | S | L | S | A | S | V | G | D | R | V | T | L | T | C | Q | A | S | Q | D | I | R | K | F | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | G | P | K | L | L | I | Y | D | A | S | N | L | Q | R | G | V | P | S | R | F | S | G | G | G | S | G | T | D | F | T | L | I | I | S | S | L | Q | P | E | D | V | G | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | D | G | L | P | F | T | F | G | G | G | T | K | V | V | I | K |
| Antigen Details | |
|---|---|
| Antigen chains | G |
| Antigen type | protein |
| Antigen name | broadly neutralizing antibody c05, heavy chain |
| Antigen species | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen sequence | ADPGATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR |
| CDR Sequences (chothia definition) | |
|---|---|
| CDRH1 | GSSFGESTLSYY |
| CDRH2 | NAGGGD |
| CDRH3 | HMSMQQVVSAGWERADLVGDAFDV |
| CDRL1 | QASQDIRKFLN |
| CDRL2 | DASNLQR |
| CDRL3 | QQYDGLPFT |
| Orientation Angles (from ABangle) | |
|---|---|
| HL | -61.07° |
| HC1 | 70.48° |
| HC2 | 116.41° |
| LC1 | 119.32° |
| LC2 | 83.63° |
| dc | 16.27Å |
Schneider, C., Raybould, M.I.J., Deane, C.M. (2022) SAbDab in the Age of Biotherapeutics: Updates including SAbDab-Nano, the Nanobody Structure Tracker. Nucleic Acids Res. 50(D1):D1368-D1372 [link]
SAbDab paper: Dunbar, J., Krawczyk, K. et al (2014). Nucleic Acids Res. 42. D1140-D1146 [link]
Thera-SAbDab paper: Raybould, M.I.J., Marks, C. et al (2019). Nucleic Acids Res. gkz827 [link]
