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Murine T-Cell Receptor Variable Domain/Fab complex
Item | Info |
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PDB | 1kb5 |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.5Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV1/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV14/TRAJ15 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | L | H |
Antigen Type | Protein |
Antigen Organism | MUS MUSCULUS |
Antigen Sequence | DIQMTQSPASLSASVGETVTITCRASKNIYSYLAWYQQKQGKSPQLLVYNAKTLGEGVPSRFSGSGSGTQFSLKINSLQPEDFGSYYCQHHYGTPYTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC/EVQLQQSGPELEKPGASVKISCKASGYSFTGYNMNWVKQSNGKSLEWIGNIDPYYGGISYNQKFKGRATLTVDKSSSTAYMQLKSLTSEDSAVYYCARSRTDLYYFDYWGQGTTLTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPR |
Antigen Length | 434 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | TCSAAPDWGASAETLY | None | 16 |
CDRB2 | LRSPGD | B2-6-C | 6 |
CDRB1 | NSQYPW | B1-6-A | 6 |
CDRA3 | AARYQGGRALI | None | 11 |
CDRA2 | IRSVSDK | None | 7 |
CDRA1 | DSTFNY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 109.22° |
BC1 | 77.68° |
BA | -59.58° |
AC2 | 80.82° |
AC1 | 123.64° |
dc | 15.94Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5c0a_ED | 110.76° | 79.27° | -60.64° | 81.16° | 122.52° | 15.82Å | 2.7 |
8d5p_DC | 110.20° | 78.67° | -57.64° | 81.97° | 124.77° | 15.75Å | 2.9 |
3uts_ED | 109.15° | 79.11° | -59.05° | 83.20° | 121.82° | 15.95Å | 3.4 |
5c0a_JI | 110.98° | 79.72° | -61.04° | 79.90° | 122.30° | 15.78Å | 3.5 |
5c09_JI | 111.34° | 79.36° | -61.57° | 81.44° | 122.47° | 15.87Å | 3.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1cl7_HL | 111.63° | 74.67° | -60.00° | 82.67° | 121.69° | 16.39Å | 4.7 |
3u7y_HL | 113.61° | 76.93° | -60.36° | 81.15° | 125.35° | 15.13Å | 4.9 |
4s1s_HL | 113.28° | 75.84° | -59.86° | 79.98° | 125.57° | 15.71Å | 4.9 |
4jkp_HL | 113.93° | 77.37° | -58.92° | 82.11° | 124.47° | 15.16Å | 5.1 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 5.1 |