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Sars-Cov-2 Ylq Peptide-Specific TCR Pylq7
Item | Info |
---|---|
PDB | 7n1d |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.35Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ30 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSPDIEQY | None | 9 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | AVNRDDKII | None | 9 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 106.38° |
BC1 | 73.76° |
BA | -59.21° |
AC2 | 80.80° |
AC1 | 122.66° |
dc | 16.29Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2ckb_BA | 107.00° | 73.44° | -59.14° | 79.11° | 122.23° | 16.21Å | 1.9 |
6xco_ED | 106.09° | 72.66° | -60.59° | 81.18° | 123.57° | 16.24Å | 2.0 |
4pj7_HG | 105.25° | 72.70° | -59.22° | 80.59° | 124.15° | 16.85Å | 2.2 |
7pbe_ED | 106.19° | 72.72° | -57.80° | 79.41° | 123.62° | 16.51Å | 2.5 |
3e2h_CB | 106.69° | 73.41° | -60.12° | 80.34° | 124.94° | 16.55Å | 2.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 4.8 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 5.0 |
4hxb_HL | 109.66° | 72.24° | -59.19° | 82.14° | 119.35° | 16.41Å | 5.1 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 5.4 |
2dbl_HL | 110.84° | 73.37° | -61.14° | 82.14° | 120.45° | 16.63Å | 5.5 |