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complex of T Cell Receptor with Hhat Neoantigen Peptide Kqwlvwlfl Presented By HLA-A206
Item | Info |
---|---|
PDB | 6uk4 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.7Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV38/TRAJ33 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSRTSPTDTQY | None | 12 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHNS | None | 5 |
CDRA3 | AFMDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | QEAYKQQN | None | 8 |
CDRA1 | TSESDYY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.96° |
BC1 | 75.02° |
BA | -60.42° |
AC2 | 82.42° |
AC1 | 123.81° |
dc | 16.23Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6uk2_ED | 104.60° | 75.28° | -60.62° | 83.33° | 123.40° | 16.30Å | 1.2 |
8gon_ED | 103.49° | 75.55° | -61.43° | 81.60° | 124.75° | 16.19Å | 1.8 |
4pjg_HG | 104.58° | 73.37° | -61.10° | 81.28° | 123.99° | 16.74Å | 2.3 |
6pum_ED | 103.73° | 73.19° | -60.91° | 80.68° | 123.91° | 16.79Å | 2.6 |
4l4t_HG | 104.34° | 73.33° | -61.42° | 80.83° | 123.97° | 16.75Å | 2.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 7.0 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 7.4 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.6 |
5te7_HL | 110.03° | 71.72° | -60.97° | 83.32° | 120.63° | 16.37Å | 7.7 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 7.7 |