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Crystal Structure of Human 21Lt2-2 TCR Bound to HLA-A*03:01 in complex with a Mutant Pik3Ca Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7l1d |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.11Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ44 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSGLAGGPVSGANVLT | None | 17 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | AGNTGTASKLT | None | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 108.17° |
BC1 | 74.45° |
BA | -61.05° |
AC2 | 77.10° |
AC1 | 121.46° |
dc | 15.99Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4elk_DC | 107.78° | 73.08° | -62.74° | 78.08° | 121.76° | 16.21Å | 2.4 |
7rm4_NO | 105.38° | 74.83° | -61.30° | 76.97° | 121.77° | 15.91Å | 2.8 |
7n2q_GE | 106.59° | 76.10° | -61.16° | 78.55° | 120.08° | 15.80Å | 3.0 |
8i5c_ED | 106.34° | 73.41° | -61.79° | 78.05° | 123.49° | 16.53Å | 3.2 |
3qh3_BA | 105.57° | 74.49° | -59.76° | 76.29° | 122.79° | 16.23Å | 3.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 4.8 |
3wih_IM | 112.74° | 73.69° | -62.39° | 76.91° | 120.77° | 15.54Å | 4.9 |
5f9w_HL | 110.50° | 73.01° | -61.98° | 80.06° | 118.29° | 16.39Å | 5.2 |
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 5.3 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 5.4 |