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complex Between Human T-Cell Receptor, Viral Peptide (Tax), and HLA-A 0201
Item | Info |
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PDB | 1ao7 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.6Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ24 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN T-LYMPHOTROPIC VIRUS 1 |
Antigen Sequence | LLFGYPVYV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASRPGLAGGRPEQY | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTTDSWGKLQ | A3-11-C | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.22° |
BC1 | 70.44° |
BA | -53.35° |
AC2 | 82.76° |
AC1 | 124.53° |
dc | 17.28Å |
Docking angle | 34.83° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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1qrn_ED | 100.87° | 70.09° | -53.19° | 83.07° | 125.46° | 17.07Å | 1.1 |
1qsf_ED | 100.59° | 70.43° | -53.95° | 81.96° | 125.01° | 16.83Å | 1.4 |
1qse_ED | 100.14° | 70.59° | -54.40° | 82.15° | 125.25° | 17.00Å | 1.8 |
3d3v_ED | 99.52° | 70.54° | -54.24° | 82.63° | 124.54° | 17.02Å | 1.9 |
4ftv_ED | 99.81° | 71.28° | -54.23° | 82.78° | 124.49° | 16.98Å | 1.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 6.7 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 7.9 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.3 |
1cft_BA | 107.61° | 67.68° | -51.49° | 84.71° | 119.99° | 16.31Å | 8.8 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.0 |