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complex Between Human T-Cell Receptor B7, Viral Peptide (Tax) and MHC Class I Molecule HLA-A 0201
Item | Info |
---|---|
PDB | 1bd2 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.5Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV29/TRAJ54 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HUMAN T-LYMPHOTROPIC VIRUS 1 |
Antigen Sequence | LLFGYPVYV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSYPGGGFYEQY | None | 13 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AAMEGAQKLV | None | 10 |
CDRA2 | ISSIKDK | None | 7 |
CDRA1 | NSMFDY | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 107.65° |
BC1 | 72.19° |
BA | -66.15° |
AC2 | 74.33° |
AC1 | 122.29° |
dc | 16.53Å |
Docking angle | 49.40° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4x6b_BA | 106.44° | 72.79° | -65.34° | 74.60° | 121.74° | 16.56Å | 1.7 |
2pxy_BA | 107.69° | 72.09° | -67.17° | 74.08° | 123.73° | 16.39Å | 1.8 |
3tf7_Kk | 107.96° | 70.69° | -66.52° | 74.33° | 123.32° | 17.13Å | 2.0 |
2z31_BA | 107.66° | 72.97° | -66.65° | 73.04° | 123.84° | 16.30Å | 2.2 |
2j8u_ML | 107.93° | 72.98° | -66.36° | 73.99° | 124.42° | 16.81Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 2.6 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 4.3 |
1jv5_BA | 111.45° | 73.74° | -67.77° | 74.39° | 122.07° | 15.49Å | 4.5 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 5.2 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 5.6 |