Structure summary for 1h5b

Detailed entry information.

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Details for 1h5b

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Structure information

T Cell Receptor Valpha11 (av11S5) Domain

ItemInfo
PDB1h5b
OrganismMUS MUSCULUS
MethodX-RAY DIFFRACTION
Resolution1.85Å
Number of TCRs4
Paired chains information

This PDB has 4 TCR(s).

A / NA
TCR Details:
ItemInfo
VA chainA
VA IMGT detailsTRAV4/TRAJ22
Speciesmouse
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VAA FASTA file
A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
G D Q V E Q S P
A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16
S A L S L H E G
A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24
T D S A L R C N
A25 A26 A27 A28 A29 A37 A38 A39
F T T T M R S V
A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47
Q W F R Q N S R
A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55
G S L I S L F Y
A56 A57 A58 A64 A65 A66 A67 A68
L A S G T K E N
A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81
G R L K S A F D
A82 A83 A84 A84A A85 A86 A87 A88
S E R A R Y S T
A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96
L H I R D A Q L
A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104
E D S G T Y F C
A105 A106 A107 A108 A109 A110 A112 A113
A A E A S S G S
A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121
W Q L I F G S G
A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128
T Q L T V M P
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRA3AAEASSGSWQLINone12
CDRA2LASGTNone5
CDRA1TTMRSNone5

B / NA
TCR Details:
ItemInfo
VA chainB
VA IMGT detailsTRAV4/TRAJ22
Speciesmouse
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VAB FASTA file
A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
G D Q V E Q S P
A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16
S A L S L H E G
A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24
T D S A L R C N
A25 A26 A27 A28 A29 A37 A38 A39
F T T T M R S V
A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47
Q W F R Q N S R
A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55
G S L I S L F Y
A56 A57 A58 A64 A65 A66 A67 A68
L A S G T K E N
A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81
G R L K S A F D
A82 A83 A84 A84A A85 A86 A87 A88
S K E R R Y S T
A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96
L H I R D A Q L
A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104
E D S G T Y F C
A105 A106 A107 A108 A109 A110 A112 A113
A A E A S S G A
A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121
W Q L I F G S G
A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128
T Q L T V M P
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRA3AAEASSGAWQLINone12
CDRA2LASGTNone5
CDRA1TTMRSNone5

C / NA
TCR Details:
ItemInfo
VA chainC
VA IMGT detailsTRAV4/TRAJ22
Speciesmouse
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VAC FASTA file
A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
G D Q V E Q S P
A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16
S A L S L H E G
A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24
T D S A L R C N
A25 A26 A27 A28 A29 A37 A38 A39
F T T T M R S V
A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47
Q W F R Q N S R
A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55
G S L I S L F Y
A56 A57 A58 A64 A65 A66 A67 A68
L A S G T K E N
A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81
G R L K S A F D
A82 A83 A84 A84A A85 A86 A87 A88
S K E R R Y S T
A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96
L H I R D A Q L
A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104
E D S G T Y F C
A105 A106 A107 A108 A109 A110 A112 A113
A A E A S S G S
A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121
W Q L I F G S G
A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128
T Q L T V M P
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRA3AAEASSGSWQLINone12
CDRA2LASGTNone5
CDRA1TTMRSNone5

D / NA
TCR Details:
ItemInfo
VA chainD
VA IMGT detailsTRAV4/TRAJ22
Speciesmouse
Numbered sequence
Chain typeChain IDFASTA/Annotation fileIMGT numbered sequence (Framework/CDR)
VAD FASTA file
A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
G D Q V E Q S P
A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16
S A L S L H E G
A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24
T D S A L R C N
A25 A26 A27 A28 A29 A37 A38 A39
F T T T M R S V
A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47
Q W F R Q N S R
A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55
G S L I S L F Y
A56 A57 A58 A64 A65 A66 A67 A68
L A S G T K E N
A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81
G R L K S A F D
A82 A83 A84 A84A A85 A86 A87 A88
S K E R R Y S T
A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96
L H I R D A Q L
A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104
E D S G T Y F C
A105 A106 A107 A108 A109 A110 A112 A113
A A E A S S G A
A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121
W Q L I F G S G
A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128
T Q L T V M P
CDR Sequences:
LoopSequencePredicted canonical formCDR Length
CDRA3AAEASSGAWQLINone12
CDRA2LASGTNone5
CDRA1TTMRSNone5

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ItemLink
IMGT-numbered structureLink
Non-annotated structure from the PDBLink
Summary file for this TCRLink
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