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Structure of the HLA-E-Vmaprtlil/Kk50.4 TCR complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 2esv |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.6Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV14/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ37 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | VMAPRTLIL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-E*0101 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSQDRDTQY | None | 10 |
CDRB2 | FVKESK | None | 6 |
CDRB1 | SGHDN | None | 5 |
CDRA3 | IVVRSSNTGKLI | None | 12 |
CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 107.82° |
BC1 | 72.93° |
BA | -61.63° |
AC2 | 93.92° |
AC1 | 130.54° |
dc | 17.31Å |
Docking angle | 39.36° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 2.7 |
4z7v_FE | 111.26° | 73.06° | -61.69° | 93.39° | 131.70° | 17.14Å | 3.7 |
4z7v_HG | 111.21° | 73.03° | -62.36° | 92.92° | 131.88° | 17.12Å | 3.9 |
7byd_ED | 106.28° | 72.10° | -62.40° | 91.36° | 127.86° | 17.61Å | 4.2 |
7ndt_JI | 108.10° | 73.44° | -65.10° | 92.34° | 128.92° | 17.26Å | 4.2 |