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a Structural Basis For Selection and Cross-Species Reactivity of the Semi-invariant Nkt Cell Receptor in CD1D/Glycolipid Recognition
Item | Info |
---|---|
PDB | 2eyr |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.4Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV25/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV10/TRAJ18 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASTSRRGSYEQY | None | 12 |
CDRB2 | SYGVNS | None | 6 |
CDRB1 | MGHDK | None | 5 |
CDRA3 | VVSDRGSTLGRLY | None | 13 |
CDRA2 | MTFSENT | None | 7 |
CDRA1 | VSPFSN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.43° |
BC1 | 68.62° |
BA | -46.73° |
AC2 | 86.93° |
AC1 | 131.51° |
dc | 17.76Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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2eys_BA | 105.18° | 68.91° | -48.08° | 87.29° | 132.33° | 17.71Å | 1.7 |
4pj8_DC | 103.12° | 69.08° | -49.98° | 85.22° | 131.61° | 17.49Å | 4.4 |
7t2c_ED | 104.92° | 66.74° | -49.42° | 86.71° | 135.06° | 18.39Å | 4.9 |
2cde_BA | 102.73° | 68.97° | -51.15° | 85.99° | 130.58° | 17.61Å | 5.4 |
3vxt_DC | 105.54° | 68.24° | -49.02° | 82.96° | 128.68° | 17.67Å | 5.4 |