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Crystal Structures of High affinity Human T-Cell Receptors Bound to PMHC Revealnative Diagonal Binding Geometry Unbound TCR Clone 5-1
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 2pyf |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.2Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV21/TRAJ6 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSYLGNTGELF | None | 12 |
| CDRB2 | SVGAGT | None | 6 |
| CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
| CDRA3 | AVRPLLDGTYIPT | None | 13 |
| CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
| CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 97.64° |
| BC1 | 70.19° |
| BA | -53.60° |
| AC2 | 80.15° |
| AC1 | 121.02° |
| dc | 16.57Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2bnu_BA | 98.54° | 71.21° | -52.35° | 79.71° | 120.08° | 16.42Å | 2.1 |
| 4e42_BA | 100.75° | 70.98° | -53.41° | 81.65° | 121.31° | 16.13Å | 3.6 |
| 7r7z_BA | 100.53° | 71.60° | -53.55° | 78.38° | 120.55° | 15.99Å | 3.7 |
| 7r80_BA | 100.45° | 70.33° | -56.65° | 80.08° | 121.79° | 16.21Å | 4.2 |
| 3h9s_ED | 99.13° | 70.40° | -55.69° | 81.09° | 124.49° | 16.87Å | 4.4 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 9.9 |