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Crystal Structure of the complex Between Human T Cell Receptor and Staphylococcal Enterotoxin
Item | Info |
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PDB | 2xna |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV27/TRAJ42 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Protein |
Antigen Organism | STAPHYLOCOCCUS AUREUS |
Antigen Sequence | EDLHDKSELTDLALANAYGQYNHPFIKENIKSDEISGEKDLIFRNQGDSGNDLRVKFATADLAQKFKNKNVDIYGASFYYKCEKISENISECLYGGTTLNSEKLAQERVIGANVWVDGIQKETELIRTNKKNVTLQELDIKIRKILSDKYKIYYKDSEISKGLIEFDMKTPRDYSFDIYDLKGENDYEIDKIYEDNKTLKSDDISHIDVNLYTKKKV |
Antigen Length | 217 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSSRSSYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AGAGSQGNLI | A3-10-C | 10 |
CDRA2 | VVTGGEV | None | 7 |
CDRA1 | SVFSS | None | 5 |
Angle | Value |
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BC2 | 99.93° |
BC1 | 68.06° |
BA | -54.18° |
AC2 | 77.97° |
AC1 | 125.53° |
dc | 17.01Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2gj6_ED | 100.49° | 70.12° | -55.19° | 80.35° | 125.00° | 17.00Å | 3.4 |
6mtm_ED | 103.55° | 66.89° | -53.84° | 76.88° | 125.84° | 16.36Å | 4.0 |
6vmc_ED | 100.88° | 70.42° | -52.90° | 80.33° | 126.96° | 17.14Å | 4.0 |
6vm9_ED | 101.11° | 71.23° | -53.89° | 80.26° | 126.06° | 16.94Å | 4.1 |
4eup_HG | 100.47° | 71.36° | -55.50° | 80.20° | 125.61° | 16.91Å | 4.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.9 |