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the complex Between TCR Dmf4 and Human Class I MHC HLA-A2 with the Bound Mart-1(27-35) Nonameric Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 3qeq |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.59Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV10/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV35/TRAJ49 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | AAGIGILTV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AISEVGVGQPQH | None | 12 |
CDRB2 | SYGVKD | None | 6 |
CDRB1 | ENHRY | None | 5 |
CDRA3 | AGGTGNQFY | None | 9 |
CDRA2 | LYKAGEL | None | 7 |
CDRA1 | SIFNT | None | 5 |
Angle | Value |
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BC2 | 103.07° |
BC1 | 72.87° |
BA | -62.60° |
AC2 | 75.79° |
AC1 | 121.69° |
dc | 16.17Å |
Docking angle | 44.35° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5tez_JI | 104.37° | 71.65° | -61.90° | 74.92° | 122.39° | 16.18Å | 2.2 |
3qh3_DC | 103.38° | 73.21° | -61.36° | 77.35° | 122.64° | 16.34Å | 2.3 |
8shi_JI | 103.32° | 71.33° | -63.29° | 76.98° | 120.64° | 16.23Å | 2.3 |
6uz1_ED | 103.15° | 73.02° | -61.74° | 74.37° | 123.46° | 16.24Å | 2.4 |
6uz1_JI | 103.24° | 72.55° | -60.29° | 76.44° | 122.02° | 16.41Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 7.1 |
4uil_HL | 109.73° | 69.62° | -65.41° | 77.88° | 119.52° | 16.24Å | 8.5 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.5 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 8.7 |