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Crystal Structure of the 2B4 TCR in complex with Mcc/I-Ek
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 3qib |
| Organism | CHIMERIC HOMO SAPIENS/MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.7Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | D |
| VA chain | C |
| VB IMGT details | TRBV26/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ56 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | MANDUCA SEXTA |
| Antigen Sequence | ADLIAYLKQATKG |
| Antigen Length | 13 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | mouse |
| MHC IMGT details | H2-EA / H2-EB1k |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | D | FASTA file |
|
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| VA | C | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLNWSQDTQY | None | 12 |
| CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
| CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
| CDRA3 | AALRATGGNNKLT | None | 13 |
| CDRA2 | LASGT | None | 5 |
| CDRA1 | TTMRA | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 96.76° |
| BC1 | 72.09° |
| BA | -61.86° |
| AC2 | 81.15° |
| AC1 | 122.15° |
| dc | 16.00Å |
| Docking angle | 36.29° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3qjh_BA | 95.35° | 72.28° | -61.51° | 81.70° | 120.10° | 16.33Å | 2.6 |
| 3qjh_DC | 95.16° | 71.23° | -62.76° | 80.66° | 120.31° | 16.37Å | 2.8 |
| 3qjf_DC | 97.53° | 73.90° | -60.55° | 80.10° | 120.92° | 15.55Å | 2.9 |
| 7t2d_ON | 98.58° | 72.77° | -62.78° | 79.21° | 121.28° | 15.79Å | 3.0 |
| 6bga_DC | 97.05° | 72.68° | -63.59° | 79.78° | 120.33° | 15.68Å | 3.0 |