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Crystal Structure of the 226 TCR in complex with Mcc/I-Ek
Item | Info |
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PDB | 3qiu |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.7Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | D |
VA chain | C |
VB IMGT details | TRBV26/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV4/TRAJ16 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | E |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | MANDUCA SEXTA |
Antigen Sequence | ADLIAYLKQATKG |
Antigen Length | 13 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | H2-EA / H2-EB1k |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | D | FASTA file |
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VA | C | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLNNANSDYT | None | 12 |
CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
CDRA3 | AAEPSSGQKLV | None | 11 |
CDRA2 | LASGT | None | 5 |
CDRA1 | TTMRA | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 93.79° |
BC1 | 71.99° |
BA | -63.21° |
AC2 | 79.00° |
AC1 | 117.68° |
dc | 15.64Å |
Docking angle | 38.84° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3qiw_DC | 94.96° | 73.20° | -62.92° | 79.88° | 117.87° | 15.70Å | 1.9 |
4p2q_ON | 93.32° | 71.51° | -62.87° | 78.60° | 119.84° | 16.51Å | 2.5 |
4p2r_ON | 93.64° | 71.61° | -63.23° | 78.69° | 120.05° | 16.45Å | 2.6 |
4p2q_ED | 93.07° | 71.17° | -62.96° | 78.58° | 120.63° | 16.55Å | 3.3 |
4p2r_JI | 93.74° | 71.57° | -63.19° | 79.51° | 121.03° | 16.35Å | 3.5 |