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Crystal Structure of the 226 TCR in complex with Mcc-P5E/I-Ek
Item | Info |
---|---|
PDB | 3qiw |
Organism | CHIMERIC MANDUCA SEXTA/MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | D |
VA chain | C |
VB IMGT details | TRBV26/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV4/TRAJ16 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | E |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | MUS MUSCULUS |
Antigen Sequence | ADLIAYLEQATKG |
Antigen Length | 13 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | H2-EA / H2-EB1k |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | D | FASTA file |
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VA | C | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLNNANSDYT | None | 12 |
CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
CDRA3 | AAEPSSGQKLV | None | 11 |
CDRA2 | LASGT | None | 5 |
CDRA1 | TTMRA | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 94.96° |
BC1 | 73.20° |
BA | -62.92° |
AC2 | 79.88° |
AC1 | 117.87° |
dc | 15.70Å |
Docking angle | 39.87° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3qiu_DC | 93.79° | 71.99° | -63.21° | 79.00° | 117.68° | 15.64Å | 1.9 |
4p2r_ON | 93.64° | 71.61° | -63.23° | 78.69° | 120.05° | 16.45Å | 3.3 |
3qjh_DC | 95.16° | 71.23° | -62.76° | 80.66° | 120.31° | 16.37Å | 3.3 |
6bga_DC | 97.05° | 72.68° | -63.59° | 79.78° | 120.33° | 15.68Å | 3.3 |
4p2q_ON | 93.32° | 71.51° | -62.87° | 78.60° | 119.84° | 16.51Å | 3.4 |