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Crystal Structure of a Complete Ternary complex of T Cell Receptor, Peptide-MHC and Cd4
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 3t0e |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 4Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | D |
| VA chain | C |
| VB IMGT details | TRBV20/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV26/TRAJ32 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-DRA*0101 / HLA-DRB1*0401 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | D | FASTA file |
|
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| VA | C | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | SARGGSYNSPLH | None | 12 |
| CDRB2 | SNEGSKA | None | 7 |
| CDRB1 | DFQATT | None | 6 |
| CDRA3 | TVYGGATNKLI | None | 11 |
| CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 104.85° |
| BC1 | 71.10° |
| BA | -52.97° |
| AC2 | 88.52° |
| AC1 | 133.53° |
| dc | 17.82Å |
| Docking angle | 36.89° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3o6f_HG | 104.58° | 69.75° | -54.07° | 87.97° | 132.76° | 17.81Å | 2.0 |
| 7sg2_ED | 106.67° | 69.23° | -53.38° | 88.19° | 132.97° | 18.09Å | 2.7 |
| 8sgb_DC | 104.44° | 69.27° | -53.20° | 89.63° | 135.21° | 18.20Å | 2.8 |
| 3o6f_DC | 103.49° | 71.13° | -50.50° | 89.54° | 132.65° | 17.59Å | 3.1 |
| 7sg1_ED | 108.08° | 69.88° | -51.96° | 88.28° | 133.28° | 18.06Å | 3.6 |