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42F3-P3a1/H2-Ld complex
Item | Info |
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PDB | 3tjh |
Organism | CHIMERIC HOMO SAPIENS/MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.12Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | D |
VA chain | C |
VB IMGT details | TRBV13/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV9/TRAJ58 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | B |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | SPLDSLWWI |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | NA |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | H2-Ld-2 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | D | FASTA file |
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VA | C | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSDAPGQLY | None | 10 |
CDRB2 | SYGAGN | None | 6 |
CDRB1 | NSHNY | None | 5 |
CDRA3 | AVSAKGTGSKLS | None | 12 |
CDRA2 | YYSGDPVV | None | 8 |
CDRA1 | YSATPY | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 106.75° |
BC1 | 68.71° |
BA | -59.08° |
AC2 | 75.44° |
AC1 | 127.99° |
dc | 17.46Å |
Docking angle | 22.42° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
8dv4_ED | 105.50° | 68.87° | -60.12° | 75.02° | 128.76° | 17.69Å | 1.9 |
6dfw_FE | 107.30° | 70.29° | -58.74° | 73.73° | 127.12° | 17.20Å | 2.6 |
6c09_DC | 104.72° | 69.41° | -59.07° | 75.75° | 126.51° | 16.63Å | 2.8 |
6cuh_BA | 105.70° | 69.71° | -56.90° | 76.95° | 129.69° | 17.44Å | 3.5 |
6cug_ED | 105.61° | 69.35° | -58.93° | 78.38° | 129.60° | 17.66Å | 3.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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2rcs_HL | 112.26° | 67.90° | -60.45° | 80.52° | 124.97° | 16.31Å | 8.3 |
4x4x_CD | 112.33° | 72.96° | -60.80° | 78.66° | 125.88° | 15.67Å | 8.4 |
2v7h_HL | 112.61° | 69.11° | -59.52° | 80.37° | 123.35° | 15.85Å | 9.1 |
4zxb_CD | 111.97° | 68.75° | -59.36° | 81.84° | 123.87° | 16.46Å | 9.3 |
2adf_HL | 113.58° | 69.32° | -58.51° | 79.47° | 123.32° | 16.19Å | 9.3 |