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1E6 TCR Specific For HLA-A*0201-alwgpdpaaa
Item | Info |
---|---|
PDB | 3utp |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.574Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.67° |
BC1 | 75.56° |
BA | -65.45° |
AC2 | 75.52° |
AC1 | 123.14° |
dc | 16.18Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2jcc_ML | 108.06° | 74.29° | -65.45° | 75.02° | 124.73° | 16.72Å | 2.6 |
6v13_ED | 106.65° | 74.00° | -66.07° | 74.03° | 124.56° | 16.59Å | 2.7 |
2j8u_FE | 108.31° | 74.02° | -66.29° | 74.42° | 123.85° | 16.69Å | 2.8 |
2jcc_FE | 109.08° | 74.58° | -66.28° | 75.05° | 124.04° | 16.62Å | 2.9 |
7n2o_FD | 106.34° | 74.73° | -64.81° | 77.13° | 120.85° | 15.94Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.2 |
1jv5_BA | 111.45° | 73.74° | -67.77° | 74.39° | 122.07° | 15.49Å | 5.9 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 6.4 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 6.4 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.4 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | L |
VA chain | K |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | L | FASTA file |
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VA | K | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 112.41° |
BC1 | 78.45° |
BA | -59.63° |
AC2 | 79.12° |
AC1 | 121.28° |
dc | 16.17Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5c08_ED | 111.93° | 80.00° | -60.13° | 80.39° | 121.87° | 15.78Å | 2.2 |
5c07_ED | 112.10° | 80.10° | -60.76° | 80.35° | 122.08° | 15.77Å | 2.5 |
5c0a_JI | 110.98° | 79.72° | -61.04° | 79.90° | 122.30° | 15.78Å | 2.7 |
5c0b_JI | 112.28° | 80.10° | -60.73° | 80.73° | 121.94° | 15.83Å | 2.7 |
5c0c_ED | 112.16° | 79.79° | -60.27° | 81.04° | 122.31° | 15.89Å | 2.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3cvh_QR | 113.65° | 77.38° | -59.58° | 79.78° | 118.82° | 15.93Å | 3.0 |
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 3.6 |
5f45_HL | 113.99° | 76.58° | -57.10° | 79.66° | 119.86° | 16.52Å | 3.9 |
5dum_HL | 112.74° | 74.77° | -58.24° | 80.30° | 121.12° | 16.51Å | 4.1 |
4jj5_BA | 113.30° | 75.08° | -58.94° | 79.43° | 123.53° | 16.49Å | 4.2 |