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Mucosal-associated invariant T Cell Receptor, Valpha7.2Jalpha33-Vbeta2
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4dzb |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 1.7Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV20/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | SARTSGDFGEQF | None | 12 |
| CDRB2 | SNEGSKA | None | 7 |
| CDRB1 | DFQATT | None | 6 |
| CDRA3 | AFMDSNYQLI | None | 10 |
| CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
| CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 105.86° |
| BC1 | 68.09° |
| BA | -51.34° |
| AC2 | 83.86° |
| AC1 | 131.28° |
| dc | 17.17Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3vxt_BA | 105.58° | 68.21° | -50.00° | 82.91° | 128.68° | 17.61Å | 3.1 |
| 4pj8_DC | 103.12° | 69.08° | -49.98° | 85.22° | 131.61° | 17.49Å | 3.5 |
| 2cde_DC | 103.64° | 70.43° | -50.60° | 83.45° | 129.89° | 17.47Å | 3.6 |
| 3vxt_DC | 105.54° | 68.24° | -49.02° | 82.96° | 128.68° | 17.67Å | 3.7 |
| 3vxu_JI | 108.75° | 67.48° | -50.66° | 85.59° | 129.55° | 16.93Å | 3.9 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.6 |
| 5mvz_AB | 112.73° | 69.79° | -54.63° | 83.84° | 125.71° | 16.42Å | 9.6 |
| 4qth_AB | 111.26° | 70.26° | -51.98° | 83.39° | 123.62° | 16.07Å | 9.7 |